More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4823 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 
446 aa  873    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.26 
 
 
497 aa  242  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.67 
 
 
562 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.79 
 
 
522 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.57 
 
 
460 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.41 
 
 
464 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  34.38 
 
 
461 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.78 
 
 
487 aa  177  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.35 
 
 
497 aa  177  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.87 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.81 
 
 
489 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.21 
 
 
478 aa  172  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.75 
 
 
480 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  32.79 
 
 
490 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.02 
 
 
463 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.77 
 
 
462 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.3 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.61 
 
 
461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.09 
 
 
518 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.63 
 
 
472 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.2 
 
 
463 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.68 
 
 
463 aa  163  6e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.02 
 
 
455 aa  163  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.62 
 
 
492 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  32.35 
 
 
469 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.66 
 
 
456 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.71 
 
 
538 aa  159  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.63 
 
 
497 aa  159  9e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.93 
 
 
483 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  31.58 
 
 
472 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33 
 
 
485 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.7 
 
 
472 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.86 
 
 
494 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  30.41 
 
 
438 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.18 
 
 
553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  31.4 
 
 
456 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  31.4 
 
 
452 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.51 
 
 
497 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.51 
 
 
488 aa  140  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.1 
 
 
488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.17 
 
 
517 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.07 
 
 
462 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.2 
 
 
449 aa  124  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.42 
 
 
428 aa  124  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  28.97 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  31.44 
 
 
466 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.44 
 
 
466 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.56 
 
 
469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.75 
 
 
478 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.84 
 
 
405 aa  108  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.85 
 
 
444 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  26.85 
 
 
484 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.1 
 
 
489 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.03 
 
 
465 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.61 
 
 
491 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.57 
 
 
498 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.93 
 
 
484 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.42 
 
 
488 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.09 
 
 
456 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  28.28 
 
 
493 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.37 
 
 
457 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  29.79 
 
 
437 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  25.92 
 
 
436 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.78 
 
 
461 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  25.06 
 
 
494 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.28 
 
 
450 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.03 
 
 
441 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.23 
 
 
468 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.87 
 
 
456 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  23.58 
 
 
437 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  24.82 
 
 
489 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  24.82 
 
 
489 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  24.82 
 
 
489 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  24.82 
 
 
489 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  24.82 
 
 
489 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.67 
 
 
446 aa  97.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.67 
 
 
459 aa  97.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  27.09 
 
 
445 aa  97.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.63 
 
 
464 aa  96.7  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.29 
 
 
501 aa  96.3  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.92 
 
 
434 aa  96.3  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  24.77 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.48 
 
 
497 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  29.46 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  25.24 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  25.3 
 
 
469 aa  94  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  23.6 
 
 
574 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.37 
 
 
496 aa  93.2  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  24.76 
 
 
493 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.54 
 
 
444 aa  93.2  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.54 
 
 
444 aa  93.2  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.48 
 
 
460 aa  93.2  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.40462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  24.76 
 
 
493 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.76 
 
 
493 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  24.76 
 
 
493 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  24.76 
 
 
493 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  24.76 
 
 
493 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  25.8 
 
 
445 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  24.76 
 
 
495 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  24.76 
 
 
495 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>