More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001579 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  100 
 
 		 437 aa  900    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  64.07 
 
 		 436 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  64.3 
 
 		 436 aa  591  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  64.12 
 
 		 423 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  64.27 
 
 		 425 aa  568  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  60.87 
 
 		 445 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  56.94 
 
 		 440 aa  497  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  41.58 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.09 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.09 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  40.7 
 
 		 471 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  40.09 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.04 
 
 		 470 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.09 
 
 		 472 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  38.9 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.26 
 
 		 475 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.48 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.26 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.26 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.39 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.56 
 
 		 468 aa  354  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.86 
 
 		 470 aa  351  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.25 
 
 		 472 aa  350  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.38 
 
 		 450 aa  316  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.77 
 
 		 450 aa  315  8e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.36 
 
 		 501 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.04 
 
 		 431 aa  289  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.59 
 
 		 445 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  37.91 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.32 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.75 
 
 		 450 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.51 
 
 		 452 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.22 
 
 		 451 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.64 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.94 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.09 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.56 
 
 		 456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.09 
 
 		 452 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.85 
 
 		 452 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.34 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  32 
 
 		 574 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  31.15 
 
 		 574 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.84 
 
 		 466 aa  223  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.41 
 
 		 491 aa  216  8e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.47 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.52 
 
 		 451 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.73 
 
 		 484 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.71 
 
 		 484 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.8 
 
 		 609 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.98 
 
 		 607 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.95 
 
 		 472 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.53 
 
 		 450 aa  206  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.86 
 
 		 658 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.55 
 
 		 633 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.96 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  30.99 
 
 		 492 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.09 
 
 		 636 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.65 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.38 
 
 		 443 aa  189  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.37 
 
 		 444 aa  182  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  28.1 
 
 		 559 aa  178  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.06 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.96 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.79 
 
 		 566 aa  170  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.46 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.17 
 
 		 524 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.36 
 
 		 476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.82 
 
 		 519 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.15 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 		 456 aa  126  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.15 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.33 
 
 		 472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  21.69 
 
 		 425 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  21.69 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.79 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  25.39 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.72 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.76 
 
 		 488 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.47 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.67 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.54 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.51 
 
 		 488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.51 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.77 
 
 		 489 aa  110  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.99 
 
 		 472 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.94 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.4 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.73 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  25.3 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  25.3 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2435  outer membrane efflux protein  27.47 
 
 		 642 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.17 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  21.8 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  20.83 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  23.06 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.26 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.65 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.86 
 
 		 470 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.22 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 497 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>