More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1445 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  100 
 
 
460 aa  919    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  59.91 
 
 
477 aa  485  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.32 
 
 
517 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.47 
 
 
538 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.73 
 
 
464 aa  249  8e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  40.68 
 
 
518 aa  243  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.54 
 
 
463 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.71 
 
 
480 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.62 
 
 
489 aa  226  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.48 
 
 
478 aa  226  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.04 
 
 
463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.18 
 
 
464 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.41 
 
 
522 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.68 
 
 
483 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  34.19 
 
 
461 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.39 
 
 
497 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  34.33 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.25 
 
 
488 aa  200  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.02 
 
 
487 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.79 
 
 
488 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.79 
 
 
497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.73 
 
 
460 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.87 
 
 
463 aa  193  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.21 
 
 
455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.03 
 
 
494 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.2 
 
 
462 aa  188  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.93 
 
 
456 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  32.5 
 
 
472 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.96 
 
 
497 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.83 
 
 
553 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  31.64 
 
 
456 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  33.41 
 
 
469 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  31.64 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  32.25 
 
 
456 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.66 
 
 
461 aa  166  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.33 
 
 
472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.82 
 
 
485 aa  163  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.79 
 
 
472 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  32.41 
 
 
472 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.89 
 
 
462 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.07 
 
 
497 aa  156  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.03 
 
 
562 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.98 
 
 
428 aa  150  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  33.64 
 
 
466 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.94 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  29.63 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.72 
 
 
464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.1 
 
 
465 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.92 
 
 
473 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.98 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.67 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  28.4 
 
 
432 aa  121  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.97 
 
 
449 aa  117  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  27.3 
 
 
423 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0068  outer membrane protein TolC, putative  24.06 
 
 
407 aa  109  9.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.896077  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0246  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.11 
 
 
538 aa  100  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.99 
 
 
446 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.56 
 
 
450 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  27.31 
 
 
454 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.68 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.11 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.51 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 
528 aa  79  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.77 
 
 
489 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.87 
 
 
473 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.87 
 
 
473 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.32 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  24.76 
 
 
469 aa  77  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.32 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.03 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  25 
 
 
738 aa  76.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.83 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.97 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.83 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.52 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 
495 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.89 
 
 
475 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.94 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.7 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.89 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.69 
 
 
456 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.64 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  22.91 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.91 
 
 
472 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.81 
 
 
441 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.19 
 
 
450 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  24.52 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.55 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.13 
 
 
512 aa  70.5  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.36 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.48 
 
 
519 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.46 
 
 
471 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  23.55 
 
 
574 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.52 
 
 
471 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.43 
 
 
469 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.38 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  23 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  22.06 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>