More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2597 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  100 
 
 		 492 aa  965    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.72 
 
 		 497 aa  240  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.16 
 
 		 562 aa  229  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.7 
 
 		 480 aa  206  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.55 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.5 
 
 		 489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  32.15 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.48 
 
 		 522 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.42 
 
 		 464 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.9 
 
 		 494 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.7 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.86 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.95 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  33.11 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.13 
 
 		 461 aa  182  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.71 
 
 		 455 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.34 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.26 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.41 
 
 		 463 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.58 
 
 		 483 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  33.58 
 
 		 452 aa  173  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.08 
 
 		 497 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  33.33 
 
 		 456 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.41 
 
 		 463 aa  170  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.88 
 
 		 518 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.52 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.38 
 
 		 462 aa  167  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.93 
 
 		 497 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.93 
 
 		 488 aa  163  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.5 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  30.12 
 
 		 472 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.18 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.11 
 
 		 477 aa  153  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.07 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.38 
 
 		 446 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  31 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.77 
 
 		 472 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.63 
 
 		 472 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  29.21 
 
 		 469 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.57 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.33 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.43 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.49 
 
 		 553 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.79 
 
 		 538 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.21 
 
 		 405 aa  127  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0246  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.96 
 
 		 538 aa  123  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.88 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  31.15 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.63 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.55 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  29.03 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  27.4 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.4 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  27.4 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  27.4 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  27.4 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  27.4 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.03 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  27.4 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  27.78 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  27.4 
 
 		 495 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  28.92 
 
 		 462 aa  107  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  26.45 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  26.45 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  26.45 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  26.45 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  26.45 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.99 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  27.11 
 
 		 494 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  28.85 
 
 		 469 aa  101  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  26.14 
 
 		 470 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.61 
 
 		 464 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.7 
 
 		 491 aa  99.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  25.71 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.61 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  25.71 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  26.35 
 
 		 465 aa  97.8  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  25.62 
 
 		 463 aa  97.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  25.29 
 
 		 463 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  27.23 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  26.21 
 
 		 497 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  27.03 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  25.64 
 
 		 423 aa  94  6e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  27.46 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.16 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  25.59 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.97 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.91 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  27.91 
 
 		 448 aa  91.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.03 
 
 		 473 aa  91.3  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  29.22 
 
 		 451 aa  90.5  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  25.3 
 
 		 435 aa  90.1  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  26.25 
 
 		 435 aa  89.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.09 
 
 		 449 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  28.57 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.75 
 
 		 476 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.03 
 
 		 442 aa  89  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  25.25 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  25.25 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>