More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1003 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 		 462 aa  910    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  47.03 
 
 		 464 aa  322  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.28 
 
 		 497 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.95 
 
 		 494 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.43 
 
 		 497 aa  274  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  41.19 
 
 		 518 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  41.72 
 
 		 538 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.98 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.61 
 
 		 522 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.67 
 
 		 460 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.29 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.81 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.91 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  38.1 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.85 
 
 		 480 aa  253  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  36.71 
 
 		 490 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.79 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.02 
 
 		 478 aa  250  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  38.15 
 
 		 488 aa  251  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.1 
 
 		 497 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.1 
 
 		 488 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.67 
 
 		 487 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  37.64 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.18 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.57 
 
 		 485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  38.44 
 
 		 438 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.98 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.45 
 
 		 472 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.13 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  40.09 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.55 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.22 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.93 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  35.51 
 
 		 469 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.97 
 
 		 553 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  36.55 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  35.86 
 
 		 456 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.13 
 
 		 517 aa  208  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  35.21 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.46 
 
 		 461 aa  202  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.58 
 
 		 562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.44 
 
 		 428 aa  194  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.96 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  33.33 
 
 		 466 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 466 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.19 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.46 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.18 
 
 		 492 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.89 
 
 		 460 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.49 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.01 
 
 		 446 aa  170  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.84 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  28.92 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.71 
 
 		 449 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.54 
 
 		 442 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0246  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.45 
 
 		 538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  28.51 
 
 		 437 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  29.44 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  28.02 
 
 		 432 aa  133  5e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.26 
 
 		 450 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.41 
 
 		 491 aa  130  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  28.02 
 
 		 484 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.98 
 
 		 512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.99 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  28.68 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.67 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  28.47 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  28 
 
 		 457 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.82 
 
 		 455 aa  123  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.07 
 
 		 461 aa  123  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  25.54 
 
 		 574 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.77 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.24 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.5 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  28 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.5 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.5 
 
 		 497 aa  120  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.8 
 
 		 453 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  25.61 
 
 		 574 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0068  outer membrane protein TolC, putative  25.89 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.896077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.83 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  25.53 
 
 		 445 aa  118  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.59 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.51 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.14 
 
 		 494 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.93 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  28.51 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.5 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  26.68 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.66 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.66 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  24.82 
 
 		 471 aa  114  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.83 
 
 		 473 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.83 
 
 		 473 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.48 
 
 		 431 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.59 
 
 		 471 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.14 
 
 		 501 aa  113  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.78 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  25.56 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>