More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1258 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1258  putative flagellar hook-associated protein 2  100 
 
 
448 aa  884    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1086  TolC protein  64.37 
 
 
448 aa  558  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0746  outer membrane protein  39.91 
 
 
461 aa  325  8.000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00126239  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1082  outer membrane efflux protein  37.77 
 
 
447 aa  292  8e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0760  outer membrane efflux protein  38.71 
 
 
432 aa  275  9e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.127184  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0711  outer membrane efflux protein  33.63 
 
 
456 aa  225  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1062  outer membrane efflux protein  32.74 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0664655  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0637  outer membrane efflux protein  32.51 
 
 
456 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.358934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2218  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.71 
 
 
432 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0395  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.12 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1793  outer membrane efflux protein  27.87 
 
 
463 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2315  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.6 
 
 
461 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.44899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1296  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.4 
 
 
479 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0834  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  26.96 
 
 
460 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2184  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 
460 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0925  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  26.72 
 
 
460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.68 
 
 
483 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00132321  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3412  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.72 
 
 
459 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4955  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.72 
 
 
459 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.525956  normal  0.0720894 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0834  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.68 
 
 
483 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.933668  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0802  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.67 
 
 
476 aa  171  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.68 
 
 
483 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00460212  hitchhiker  0.00000000259986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.72 
 
 
459 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0147852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0723  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.72 
 
 
468 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0822  outer membrane efflux family protein  25.72 
 
 
472 aa  169  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3454  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 
477 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00515771  hitchhiker  0.00444269 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.67 
 
 
471 aa  166  9e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228737  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0917  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 
446 aa  162  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.47 
 
 
482 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1561  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  27.06 
 
 
480 aa  144  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  29.3 
 
 
460 aa  144  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.42 
 
 
495 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.83 
 
 
473 aa  134  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0414  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  26.91 
 
 
492 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  24.24 
 
 
482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0388  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  26.68 
 
 
492 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.68 
 
 
479 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.12 
 
 
461 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1341  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.24 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.36 
 
 
493 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1861  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.1 
 
 
454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.26 
 
 
488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 
485 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.94 
 
 
531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.22 
 
 
475 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  26.71 
 
 
470 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1949  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.64 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0323  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.52 
 
 
496 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.501802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0667  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 
478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.84 
 
 
496 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.52 
 
 
461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.63 
 
 
495 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0610186  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.49 
 
 
486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0291  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.1 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.33434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2869  outer membrane protein  23.76 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.22 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.43 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 
569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.65 
 
 
477 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.76 
 
 
485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.7 
 
 
489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.09 
 
 
461 aa  114  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3783  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.14 
 
 
471 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.76 
 
 
485 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3525  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.89 
 
 
471 aa  113  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3838  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.64 
 
 
503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.94 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33750  putative outer membrane protein precursor  23.76 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0658035  hitchhiker  0.0026818 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.62 
 
 
494 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.69 
 
 
482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0007  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.36 
 
 
465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000120725  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.04 
 
 
495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.71 
 
 
484 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2557  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.89 
 
 
484 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.034745  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1099  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.09 
 
 
460 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.21 
 
 
478 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.88 
 
 
469 aa  110  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 
485 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.51 
 
 
484 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.52 
 
 
483 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.51 
 
 
484 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.92 
 
 
509 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.65 
 
 
470 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.84 
 
 
497 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.15 
 
 
477 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.59 
 
 
508 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  25.59 
 
 
506 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.3 
 
 
509 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  25.59 
 
 
508 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3378  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.27 
 
 
470 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469197 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.59 
 
 
508 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3998  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.57 
 
 
484 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1614  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.7 
 
 
487 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0245631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  25.42 
 
 
519 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.59 
 
 
508 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4211  RND efflux transporter  25.76 
 
 
470 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.77 
 
 
541 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  23.22 
 
 
503 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 
544 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.81 
 
 
486 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>