More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0395 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0395  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  100 
 
 
464 aa  932    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2218  RND efflux system outer membrane lipoprotein  67.06 
 
 
432 aa  568  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0925  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  54.92 
 
 
460 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0834  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  55.16 
 
 
460 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1793  outer membrane efflux protein  53.54 
 
 
463 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314198  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2184  outer membrane efflux protein  54.68 
 
 
460 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4955  RND efflux system outer membrane lipoprotein  52.22 
 
 
459 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.525956  normal  0.0720894 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0723  RND efflux system outer membrane lipoprotein  53.98 
 
 
468 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3412  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  52.22 
 
 
459 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  51.99 
 
 
459 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0147852 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3454  outer membrane efflux protein  41.43 
 
 
477 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00515771  hitchhiker  0.00444269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0822  outer membrane efflux family protein  41.52 
 
 
472 aa  363  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0802  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.11 
 
 
476 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102308  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0834  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.92 
 
 
483 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.933668  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.14 
 
 
483 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00460212  hitchhiker  0.00000000259986 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.05 
 
 
483 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00132321  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.94 
 
 
471 aa  347  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1861  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.09 
 
 
454 aa  338  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2315  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.05 
 
 
461 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.44899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1296  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.17 
 
 
479 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1099  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.78 
 
 
460 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3783  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.76 
 
 
471 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0746  outer membrane protein  28.42 
 
 
461 aa  207  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00126239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33750  putative outer membrane protein precursor  33.19 
 
 
474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0658035  hitchhiker  0.0026818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2066  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.3 
 
 
494 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1855  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  33.63 
 
 
464 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859631  normal  0.291675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2557  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.05 
 
 
484 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.034745  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2869  outer membrane protein  34.25 
 
 
474 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3723  putative outer membrane protein  35.1 
 
 
480 aa  194  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1683  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.95 
 
 
479 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2903  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.53 
 
 
482 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3931  multidrug efflux system outer membrane subunit  31.85 
 
 
507 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.06 
 
 
486 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.61 
 
 
473 aa  186  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1086  TolC protein  27.58 
 
 
448 aa  186  7e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2568  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.09 
 
 
482 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  30.59 
 
 
486 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1968  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.89 
 
 
462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1258  putative flagellar hook-associated protein 2  28.12 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.3 
 
 
494 aa  184  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  29.6 
 
 
512 aa  183  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3535  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.55 
 
 
467 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4211  RND efflux transporter  33.87 
 
 
470 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2158  outer membrane efflux protein  32.37 
 
 
467 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00293127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2841  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.63 
 
 
482 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.64 
 
 
478 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.21 
 
 
482 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1377  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.99 
 
 
456 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.38 
 
 
486 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  31.32 
 
 
470 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.91 
 
 
495 aa  177  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3284  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.89 
 
 
484 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal  0.639167 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.94 
 
 
474 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.16 
 
 
464 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.38 
 
 
484 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  28.73 
 
 
474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.6 
 
 
470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.81 
 
 
495 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.89 
 
 
487 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.74 
 
 
509 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  31 
 
 
485 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  30.35 
 
 
485 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  29.37 
 
 
469 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3525  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.18 
 
 
471 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.39 
 
 
495 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.72 
 
 
472 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  27.16 
 
 
482 aa  169  7e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2037  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.76 
 
 
489 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248346  normal  0.0238408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  28.33 
 
 
497 aa  169  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.32 
 
 
503 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.99 
 
 
531 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.9 
 
 
517 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.89 
 
 
479 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.17 
 
 
484 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.96 
 
 
484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.17 
 
 
484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.92 
 
 
496 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.47 
 
 
504 aa  167  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.92 
 
 
496 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.11 
 
 
472 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  27.84 
 
 
503 aa  167  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3466  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.64 
 
 
461 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1154  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.73 
 
 
501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.039626  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.85 
 
 
471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.63 
 
 
509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.65 
 
 
481 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.63 
 
 
477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.54 
 
 
475 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.7 
 
 
525 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.81 
 
 
485 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  29.44 
 
 
499 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.87 
 
 
475 aa  163  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.63 
 
 
457 aa  163  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.61 
 
 
493 aa  162  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.22 
 
 
486 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  30.87 
 
 
479 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  27 
 
 
460 aa  162  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.47 
 
 
507 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.23 
 
 
531 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.691413  normal  0.979015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2864  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30 
 
 
468 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0383351  normal  0.128914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>