More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1861 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1861  RND efflux system outer membrane lipoprotein  100 
 
 
454 aa  914    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2218  RND efflux system outer membrane lipoprotein  44.1 
 
 
432 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1793  outer membrane efflux protein  44 
 
 
463 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314198  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0395  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.09 
 
 
464 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0834  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  42.37 
 
 
460 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0925  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  42.37 
 
 
460 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2184  outer membrane efflux protein  42.14 
 
 
460 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0834  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.02 
 
 
483 aa  326  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.933668  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0822  outer membrane efflux family protein  37.74 
 
 
472 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.14 
 
 
471 aa  324  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228737  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0802  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.17 
 
 
476 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  37.8 
 
 
483 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00132321  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  37.8 
 
 
483 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00460212  hitchhiker  0.00000000259986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2315  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.56 
 
 
461 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.44899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3454  outer membrane efflux protein  37.67 
 
 
477 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00515771  hitchhiker  0.00444269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4955  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.27 
 
 
459 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.525956  normal  0.0720894 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1296  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.94 
 
 
479 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3412  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.27 
 
 
459 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.27 
 
 
459 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0147852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0723  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.8 
 
 
471 aa  170  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3723  putative outer membrane protein  32.94 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0746  outer membrane protein  24.82 
 
 
461 aa  162  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00126239  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3427  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.98 
 
 
470 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1341  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.82 
 
 
477 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432715  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.22 
 
 
479 aa  156  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.77 
 
 
486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.15 
 
 
487 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2903  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.35 
 
 
482 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2568  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.54 
 
 
482 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.21 
 
 
483 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  27.87 
 
 
497 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.45 
 
 
499 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.32 
 
 
465 aa  149  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  29 
 
 
503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.81 
 
 
502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.51 
 
 
464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.54 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 
569 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.94 
 
 
495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  29.68 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.79 
 
 
483 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.33 
 
 
484 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.33 
 
 
484 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  28.99 
 
 
474 aa  146  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.46 
 
 
474 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1099  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.56 
 
 
460 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  27.99 
 
 
501 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.46 
 
 
521 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  26.34 
 
 
479 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  26.34 
 
 
489 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.11 
 
 
482 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1968  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.62 
 
 
462 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0943  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.95 
 
 
484 aa  143  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1300  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.9 
 
 
468 aa  143  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.634439  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3525  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.97 
 
 
471 aa  143  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.09 
 
 
472 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1273  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.96 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0681573  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  28.94 
 
 
508 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.1 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.4 
 
 
500 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.14 
 
 
496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.27 
 
 
484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  27.52 
 
 
479 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.03 
 
 
478 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.57 
 
 
494 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.205747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.67 
 
 
493 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2066  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27 
 
 
494 aa  141  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4452  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27 
 
 
484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0511722  normal  0.669116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1364  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.72 
 
 
500 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0424146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31 
 
 
467 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  27.54 
 
 
479 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.6 
 
 
474 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6465  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.91 
 
 
475 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0283455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2158  outer membrane efflux protein  29.18 
 
 
467 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00293127  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5965  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.82 
 
 
475 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  28.81 
 
 
469 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5852  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.08 
 
 
523 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.741914 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5601  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.82 
 
 
475 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02156  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  28.71 
 
 
483 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.4 
 
 
472 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3931  multidrug efflux system outer membrane subunit  27.59 
 
 
507 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.72 
 
 
486 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.8 
 
 
486 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2841  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.04 
 
 
482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0783  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.43 
 
 
493 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1359  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.91 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  28.79 
 
 
486 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.18 
 
 
501 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.33 
 
 
470 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.88 
 
 
473 aa  137  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  28.6 
 
 
512 aa  137  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4301  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.16 
 
 
472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.9 
 
 
501 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.17 
 
 
493 aa  136  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.38 
 
 
476 aa  136  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.15 
 
 
503 aa  136  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.94 
 
 
496 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0143  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.65 
 
 
541 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.302016 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1198  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.42 
 
 
492 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0210872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>