More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0760 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0760  outer membrane efflux protein  100 
 
 
432 aa  854    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.127184  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1086  TolC protein  39.3 
 
 
448 aa  292  9e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1082  outer membrane efflux protein  39.41 
 
 
447 aa  285  9e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1258  putative flagellar hook-associated protein 2  38.84 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0711  outer membrane efflux protein  35.87 
 
 
456 aa  239  8e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1062  outer membrane efflux protein  35.86 
 
 
456 aa  239  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0664655  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0637  outer membrane efflux protein  35.59 
 
 
456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.358934  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0746  outer membrane protein  30.09 
 
 
461 aa  211  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00126239  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0917  outer membrane efflux protein  32.32 
 
 
446 aa  191  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3454  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 
477 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00515771  hitchhiker  0.00444269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0822  outer membrane efflux family protein  25.43 
 
 
472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0802  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.07 
 
 
476 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.95 
 
 
483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00132321  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.96 
 
 
471 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0834  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.68 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.933668  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.17 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00460212  hitchhiker  0.00000000259986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2218  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.36 
 
 
432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1296  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.69 
 
 
479 aa  133  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1793  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2315  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.21 
 
 
461 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.44899 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  24.12 
 
 
482 aa  125  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0414  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  26.68 
 
 
492 aa  123  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0395  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.08 
 
 
464 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0388  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  26.68 
 
 
492 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1561  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  25.54 
 
 
480 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0834  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  21.59 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0925  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  21.59 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2184  outer membrane efflux protein  21.53 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33750  putative outer membrane protein precursor  23.79 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0658035  hitchhiker  0.0026818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2869  outer membrane protein  24.64 
 
 
474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.65 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.22 
 
 
482 aa  110  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.23 
 
 
459 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0147852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.27 
 
 
486 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4955  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.23 
 
 
459 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.525956  normal  0.0720894 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3412  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.23 
 
 
459 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1101  outer membrane protein  23.17 
 
 
470 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0310  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.88 
 
 
461 aa  107  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0728642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1861  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.86 
 
 
454 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0117  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  22.17 
 
 
482 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6515  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.16 
 
 
477 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0241936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3284  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.67 
 
 
484 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal  0.639167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2158  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 
467 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00293127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1968  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.22 
 
 
462 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0723  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.62 
 
 
468 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 
569 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  24.2 
 
 
460 aa  104  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.24 
 
 
495 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  22.78 
 
 
503 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.28 
 
 
473 aa  103  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.4 
 
 
488 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3679  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  24.62 
 
 
467 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1154  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.75 
 
 
473 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182996  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  22.64 
 
 
499 aa  99.8  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2069  multidrug efflux MFS outer membrane protein, putative  22.61 
 
 
473 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.582601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.4 
 
 
486 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2738  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  21.58 
 
 
501 aa  99.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3674  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.33 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  21.71 
 
 
457 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.3 
 
 
479 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.6 
 
 
460 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  21.71 
 
 
457 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.71 
 
 
457 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.38 
 
 
494 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3599  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.81 
 
 
452 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.6 
 
 
460 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.6 
 
 
460 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.77 
 
 
495 aa  97.4  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  22.6 
 
 
457 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  22.6 
 
 
457 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.52 
 
 
485 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.21 
 
 
475 aa  96.7  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3547  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.56 
 
 
477 aa  96.7  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138729  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2317  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  20.69 
 
 
478 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2361  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  20.69 
 
 
478 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.31 
 
 
484 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2410  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  20.69 
 
 
478 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2518  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  20.69 
 
 
478 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470192  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.66 
 
 
485 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.84 
 
 
484 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.27 
 
 
485 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.12 
 
 
484 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2406  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  20.69 
 
 
478 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.2 
 
 
525 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0689129  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.33 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2820  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.33 
 
 
517 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  19.82 
 
 
461 aa  94.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.43 
 
 
499 aa  94  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  19.82 
 
 
461 aa  93.6  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2544  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.82 
 
 
467 aa  93.6  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109213  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2254  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.93 
 
 
487 aa  92.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2776  RND efflux system outer membrane lipoprotein  18.62 
 
 
487 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.425171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  22.02 
 
 
457 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1949  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.94 
 
 
459 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  19.58 
 
 
483 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.16245  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.38 
 
 
486 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.04 
 
 
500 aa  91.3  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0925  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.54 
 
 
494 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.38 
 
 
489 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0471  efflux ABC transporter outer membrane protein  23.63 
 
 
484 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>