More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0711 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0711  outer membrane efflux protein  100 
 
 
456 aa  891    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1062  outer membrane efflux protein  97.15 
 
 
456 aa  870    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0664655  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0637  outer membrane efflux protein  97.15 
 
 
456 aa  867    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.358934  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0917  outer membrane efflux protein  49.65 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0760  outer membrane efflux protein  35.87 
 
 
432 aa  219  8.999999999999998e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.127184  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1258  putative flagellar hook-associated protein 2  33.41 
 
 
448 aa  218  1e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1082  outer membrane efflux protein  33.62 
 
 
447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0746  outer membrane protein  32.76 
 
 
461 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00126239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1086  TolC protein  31.68 
 
 
448 aa  207  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0395  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.35 
 
 
464 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.09 
 
 
471 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3454  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 
477 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00515771  hitchhiker  0.00444269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.92 
 
 
483 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00132321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2315  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.35 
 
 
461 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.44899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0834  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.7 
 
 
483 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.933668  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0827  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.79 
 
 
483 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00460212  hitchhiker  0.00000000259986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0802  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.03 
 
 
476 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102308  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0822  outer membrane efflux family protein  25.85 
 
 
472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2218  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.76 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1561  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  28.02 
 
 
480 aa  123  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1861  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.79 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0117  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  26.51 
 
 
482 aa  121  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.43 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0147852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4955  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.43 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.525956  normal  0.0720894 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3412  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.43 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0414  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  26.33 
 
 
492 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0388  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  27.79 
 
 
492 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2184  outer membrane efflux protein  22.76 
 
 
460 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0834  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  22.76 
 
 
460 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0925  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  22.76 
 
 
460 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0723  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.32 
 
 
468 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291891  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1793  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 
463 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314198  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  24.55 
 
 
482 aa  105  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1296  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.56 
 
 
479 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0783  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.49 
 
 
493 aa  94.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.73 
 
 
461 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.3 
 
 
461 aa  94  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.56 
 
 
508 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  23.56 
 
 
508 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.56 
 
 
508 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.56 
 
 
508 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  23.56 
 
 
506 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  23.56 
 
 
508 aa  90.9  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  24.16 
 
 
460 aa  90.5  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  23.75 
 
 
509 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.24 
 
 
477 aa  90.5  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.33 
 
 
495 aa  90.1  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.03 
 
 
460 aa  89  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.47 
 
 
493 aa  87.8  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2903  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.6 
 
 
482 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.99 
 
 
473 aa  87.4  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.23 
 
 
494 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1085  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.19 
 
 
486 aa  86.7  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.377293  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2205  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.44 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.916558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2380  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  20.82 
 
 
481 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2568  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.28 
 
 
482 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  21.78 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.78 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  21.78 
 
 
457 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.77 
 
 
474 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  21.78 
 
 
457 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  21.78 
 
 
460 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  21.78 
 
 
457 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.99 
 
 
483 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1759  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.73 
 
 
600 aa  84  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000901075  normal  0.0327712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  23.46 
 
 
514 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3425  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.47 
 
 
461 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.55 
 
 
502 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  21.78 
 
 
460 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.81 
 
 
531 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4508  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.5 
 
 
505 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0567962 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0511  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  22.29 
 
 
497 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310056  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.02 
 
 
477 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1577  outer membrane efflux protein, OprM  26.28 
 
 
606 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000543553  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2869  outer membrane protein  22.73 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.61 
 
 
495 aa  81.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0477  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.38 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.392731  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33750  putative outer membrane protein precursor  22.32 
 
 
474 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0658035  hitchhiker  0.0026818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  22.46 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  21.62 
 
 
503 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1624  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.55 
 
 
486 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.25 
 
 
474 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.55 
 
 
486 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1949  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.91 
 
 
459 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.95 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.23 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.52 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3081  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.48 
 
 
496 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.703187  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  24.53 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.23 
 
 
485 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3547  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.87 
 
 
477 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138729  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.89 
 
 
493 aa  77  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.71 
 
 
497 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2743  outer membrane protein OprN precursor  24.75 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  20.05 
 
 
483 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.13 
 
 
496 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.44 
 
 
488 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.13 
 
 
496 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  20.51 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.85 
 
 
482 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>