62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2064 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2064  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 581 aa  1181    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2202  putative outer membrane protein  100 
 
 		 636 aa  1184    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.08 
 
 		 607 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.76 
 
 		 658 aa  61.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.39 
 
 		 609 aa  59.7  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 436 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.94 
 
 		 491 aa  56.6  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.48 
 
 		 498 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.82 
 
 		 636 aa  55.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.48 
 
 		 527 aa  53.9  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.89 
 
 		 514 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.89 
 
 		 514 aa  52  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.11 
 
 		 498 aa  50.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.89 
 
 		 498 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.89 
 
 		 498 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.11 
 
 		 498 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.89 
 
 		 498 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.89 
 
 		 498 aa  50.8  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  23.89 
 
 		 493 aa  50.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.75 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.53 
 
 		 428 aa  50.4  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.57 
 
 		 498 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.57 
 
 		 498 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  26.47 
 
 		 452 aa  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.07 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.99 
 
 		 405 aa  49.3  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  30.37 
 
 		 447 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.95 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.3 
 
 		 511 aa  49.3  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.72 
 
 		 444 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.24 
 
 		 498 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  29.91 
 
 		 447 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.43 
 
 		 501 aa  48.5  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.97 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.94 
 
 		 519 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.61 
 
 		 484 aa  47.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  19.8 
 
 		 574 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  19.55 
 
 		 574 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.74 
 
 		 489 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  30.7 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.36 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.39 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  24.44 
 
 		 511 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.16 
 
 		 503 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.918566  hitchhiker  0.00837312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  25.53 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3623  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.16 
 
 		 503 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.392647  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.53 
 
 		 515 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30 
 
 		 452 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.06 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.85 
 
 		 442 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.65 
 
 		 469 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.15 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  24.74 
 
 		 502 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1442  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 		 431 aa  44.7  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.83 
 
 		 442 aa  44.3  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5656  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.15 
 
 		 501 aa  44.3  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162521  normal  0.0223313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.03 
 
 		 489 aa  43.9  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0746  outer membrane protein  22.56 
 
 		 461 aa  44.3  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00126239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0874  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.12 
 
 		 483 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0447  Fis family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 512 aa  43.9  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5539  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.54 
 
 		 503 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.541532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25.85 
 
 		 469 aa  43.9  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>