279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2314 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2314  outer membrane efflux protein  100 
 
 
653 aa  1317    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.682449  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2690  type I secretion outer membrane protein, putative  98.83 
 
 
598 aa  1076    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0166  outer membrane channel lipoprotein  27.92 
 
 
480 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00297145  normal  0.496674 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2380  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.75 
 
 
481 aa  72  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3274  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.49 
 
 
495 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.75 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.06 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  25.06 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  25.06 
 
 
460 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  25.06 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  25.06 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  25.06 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  25.06 
 
 
460 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.81 
 
 
460 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  24.28 
 
 
479 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2193  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.46 
 
 
495 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0126086  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2776  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.34 
 
 
487 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.425171 
 
 
-
 
NC_003296  RS02156  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  23.8 
 
 
483 aa  63.9  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.910807 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.96 
 
 
481 aa  63.9  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  24.17 
 
 
498 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.52 
 
 
469 aa  63.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3793  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.81 
 
 
495 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0309  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.28 
 
 
531 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1747  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27 
 
 
496 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319328  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3821  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.07 
 
 
484 aa  60.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.467284  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4898  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.07 
 
 
484 aa  60.8  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1660  hypothetical protein  24.56 
 
 
516 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.077421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2059  Outer membrane efflux protein  24.56 
 
 
513 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26387  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.56 
 
 
485 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 
544 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.44 
 
 
497 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1905  outer membrane efflux protein OprA  24.56 
 
 
516 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0058  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.88 
 
 
579 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1891  outer membrane efflux protein OprA  24.56 
 
 
513 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.271004  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.44 
 
 
483 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.87 
 
 
464 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  23.86 
 
 
479 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3709  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.89 
 
 
500 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4291  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.13 
 
 
503 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5459  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.98 
 
 
493 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.0370061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.63 
 
 
514 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4187  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.89 
 
 
504 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164619  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4075  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.13 
 
 
503 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147604  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1086  TolC protein  25.45 
 
 
448 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.06 
 
 
474 aa  57.8  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3226  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.13 
 
 
503 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303935  normal  0.0862047 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.05 
 
 
485 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 
464 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  24.01 
 
 
499 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.97 
 
 
486 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.28 
 
 
505 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  23.51 
 
 
514 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4486  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.18 
 
 
512 aa  56.2  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5768  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.69 
 
 
499 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.20317  normal  0.984778 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3581  outer membrane protein OprN precursor  23.68 
 
 
499 aa  55.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.05 
 
 
485 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.63 
 
 
514 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3621  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 
477 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 
444 aa  55.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0055  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.87 
 
 
579 aa  55.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2670  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.2 
 
 
532 aa  55.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0133401  normal  0.268883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25 
 
 
499 aa  55.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.37 
 
 
488 aa  55.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1949  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.08 
 
 
459 aa  55.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.15 
 
 
477 aa  54.7  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3597  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.62 
 
 
501 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.09 
 
 
457 aa  54.7  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  23.63 
 
 
492 aa  54.7  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3560  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.95 
 
 
493 aa  54.3  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1624  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.6 
 
 
486 aa  54.3  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.24 
 
 
525 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1144  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.6 
 
 
486 aa  54.3  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.804634  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7725  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.51 
 
 
499 aa  53.9  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.38 
 
 
518 aa  54.3  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.29 
 
 
477 aa  53.9  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  25.66 
 
 
475 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.74 
 
 
489 aa  53.9  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.74 
 
 
496 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.74 
 
 
496 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6012  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.32 
 
 
499 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 
512 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3061  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.26 
 
 
482 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0327532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.69 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  22.36 
 
 
503 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3628  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.52 
 
 
495 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.615306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0372  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.45 
 
 
464 aa  53.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.088852 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.43 
 
 
471 aa  53.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4467  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.52 
 
 
495 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419427  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.52 
 
 
495 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.2 
 
 
434 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.62 
 
 
503 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1948  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.81 
 
 
495 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0406  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.76 
 
 
500 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.98 
 
 
510 aa  52.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.19 
 
 
511 aa  52  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.04 
 
 
507 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.93 
 
 
478 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.66 
 
 
523 aa  51.6  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  25.06 
 
 
499 aa  52  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1614  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.49 
 
 
487 aa  51.6  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0245631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>