219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4902 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 439 aa  879    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  34.04 
 
 		 437 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  34.68 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  28.34 
 
 		 438 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  26.61 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6121  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 453 aa  86.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  26.87 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.7 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  27.57 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 473 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 489 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 489 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 1496 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  21.71 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.37 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 635 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  21.55 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  20.68 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6215  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.811282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.27 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0478  outer membrane efflux protein  22.36 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  21.21 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  22.92 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.87 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1839  outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.03 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  20.13 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  20.55 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.45 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1164  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.22 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000188172  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.76 
 
 		 470 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  22.15 
 
 		 471 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  22.96 
 
 		 508 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  22.55 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  21.82 
 
 		 515 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.99 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 535 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4684  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.69 
 
 		 494 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 480 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 461 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  22.7 
 
 		 506 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  21.29 
 
 		 470 aa  53.5  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  22.7 
 
 		 508 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  22.7 
 
 		 508 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  22.7 
 
 		 508 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  22.7 
 
 		 508 aa  53.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0569  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.81 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.05 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  24.37 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  20.65 
 
 		 452 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>