58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6121 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6121  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 453 aa  921    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  32.27 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  28.05 
 
 		 451 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  27.61 
 
 		 455 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 437 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  27.48 
 
 		 635 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.73 
 
 		 461 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  25.2 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.88 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  26.34 
 
 		 731 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  28.68 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.46 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.12 
 
 		 1470 aa  56.6  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  19.86 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  20.18 
 
 		 496 aa  55.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.3 
 
 		 462 aa  54.7  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  21.24 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.05 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25.05 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.89 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  19.41 
 
 		 448 aa  51.2  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  20.9 
 
 		 1496 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  21.35 
 
 		 515 aa  50.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 458 aa  50.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  19.5 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 449 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.57 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 		 565 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.99 
 
 		 553 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 		 476 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  20.35 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.29 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  20.61 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.1 
 
 		 494 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.72 
 
 		 450 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 448 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 447 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>