228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2990 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2990  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 434 aa  883    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000136016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  24.19 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.5 
 
 		 472 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  24.19 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.2 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.76 
 
 		 538 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  22.6 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.6 
 
 		 488 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.6 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  26.5 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  24.29 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  24.29 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.76 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.54 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  26.38 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.65 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.17 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  24.57 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  20.96 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  22.54 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  21.55 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  20.96 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.98 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  20.45 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  22.58 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  23.71 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  21.79 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.29 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.11 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.05 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.91 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.31 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.28 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.11 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  23.32 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.44 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.22 
 
 		 472 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.53 
 
 		 477 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.12 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.51 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.42 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.31 
 
 		 607 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.84 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.08 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.15 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.99 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.28 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  21.87 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.65 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.54 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.71 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  21.99 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.28 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  22.32 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2274  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.59 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.28 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.78 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.74 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.76 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.29 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.29 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.42 
 
 		 636 aa  63.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.36 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.36 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.63 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.63 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  27.87 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  22.9 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  21.55 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.37 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.36 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.93 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.23 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  21.07 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.8 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  21.45 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  21.45 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.65 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  21.45 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.55 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.31 
 
 		 658 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  23.82 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.32 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  21.2 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  21.45 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  23.81 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  20.84 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.61 
 
 		 518 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.56 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  24.15 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.66 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  22.22 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.73 
 
 		 553 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  24.33 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.11 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  22.66 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.08 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  20.36 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>