67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0785 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0785  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 433 aa  876    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2845  outer membrane efflux protein  38.18 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.627274  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4326  outer membrane efflux protein  37.46 
 
 		 467 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.655626  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0278  outer membrane efflux protein  32.73 
 
 		 421 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73949  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0759  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 534 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000466855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2274  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  23.91 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1600  OMF family outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 514 aa  67  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00101188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.11 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  23.91 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.7 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  24.25 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.86 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  23.37 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  23.53 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  20.88 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.26 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.72 
 
 		 456 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.08 
 
 		 465 aa  53.5  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.67 
 
 		 464 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  24.44 
 
 		 481 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  22.5 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.33 
 
 		 489 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.69 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.78 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.69 
 
 		 450 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.62 
 
 		 472 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.09 
 
 		 470 aa  50.1  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  24.54 
 
 		 477 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0058  putative type I toxin secretion system, outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.75 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  21.55 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.89 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.79 
 
 		 450 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 439 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3706  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.27 
 
 		 498 aa  47  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3621  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 		 477 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.03 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.26 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.09 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  20.93 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.09 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.77 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  22.03 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  21.87 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3547  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.04 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  22.06 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  22.49 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.08 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.37 
 
 		 472 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.84 
 
 		 874 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.87 
 
 		 446 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.49 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  26.18 
 
 		 497 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  22.18 
 
 		 559 aa  44.3  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.95 
 
 		 496 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.77 
 
 		 538 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.19 
 
 		 471 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.55 
 
 		 431 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  20.63 
 
 		 500 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2850  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 527 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  22.83 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.24 
 
 		 456 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26.61 
 
 		 460 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  23.1 
 
 		 457 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>