67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4326 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4326  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 467 aa  944    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.655626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2845  outer membrane efflux protein  53.68 
 
 		 447 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.627274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0785  outer membrane efflux protein  37.46 
 
 		 433 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0278  outer membrane efflux protein  36.13 
 
 		 421 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73949  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0759  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 534 aa  80.1  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000466855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2274  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1600  OMF family outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00101188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  22.84 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0844  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.58 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2168  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  23.96 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.68 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.49 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.49 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  25.41 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0805  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.79 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0829  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.79 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461433 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  22.47 
 
 		 440 aa  54.3  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.46 
 
 		 470 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4381  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.89 
 
 		 477 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108825  normal  0.496475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.82 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.82 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  22.88 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  21.08 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.6 
 
 		 501 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.92 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  23.58 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1359  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.12 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.6 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  21.13 
 
 		 469 aa  50.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  22.09 
 
 		 469 aa  50.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.38 
 
 		 441 aa  50.8  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 470 aa  50.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.56 
 
 		 473 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.56 
 
 		 473 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0761  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.4 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2990  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 434 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000136016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  22.51 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.28 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.6 
 
 		 464 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  22.91 
 
 		 425 aa  46.6  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  20.77 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.5 
 
 		 609 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003047  type I secretion TolC precursor  22.97 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3678  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0849669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.62 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.58 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.48 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.61 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.57 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.38 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2043  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.46 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.186335 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  29.93 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  21.91 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.25 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.66 
 
 		 472 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.25 
 
 		 471 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.25 
 
 		 471 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.34 
 
 		 485 aa  43.5  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.04 
 
 		 475 aa  43.5  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.32 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.27 
 
 		 514 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4602  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.59 
 
 		 444 aa  43.5  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.27 
 
 		 514 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>