More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2887 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  99.36 
 
 		 469 aa  951    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  98.72 
 
 		 469 aa  942    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  100 
 
 		 469 aa  955    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  71.4 
 
 		 467 aa  654    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  98.51 
 
 		 469 aa  940    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0805  TolC family type I secretion outer membrane protein  47.33 
 
 		 478 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0844  TolC family type I secretion outer membrane protein  47.33 
 
 		 478 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0829  TolC family type I secretion outer membrane protein  47.33 
 
 		 478 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4381  TolC family type I secretion outer membrane protein  45.5 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108825  normal  0.496475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4602  type I secretion outer membrane protein, TolC family  38.88 
 
 		 444 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2168  outer membrane efflux protein  31.38 
 
 		 459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  29 
 
 		 451 aa  140  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2411  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 458 aa  133  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.562073  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.93 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3710  outer membrane efflux protein  26.04 
 
 		 564 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.07 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  26.05 
 
 		 425 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.83 
 
 		 451 aa  103  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  26.44 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05071  putative outer membrane efflux transmembrane protein  26.61 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485043  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.28 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0054  outer membrane efflux protein  26.03 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.906913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.06 
 
 		 501 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.05 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.97 
 
 		 450 aa  91.3  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.66 
 
 		 450 aa  90.9  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  23.49 
 
 		 437 aa  90.9  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.6 
 
 		 469 aa  90.1  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.24 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.26 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.54 
 
 		 636 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.3 
 
 		 463 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  23.91 
 
 		 445 aa  87.4  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.3 
 
 		 457 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.85 
 
 		 456 aa  87  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  24.69 
 
 		 456 aa  86.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25.06 
 
 		 469 aa  86.7  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.11 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.55 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  25.63 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.37 
 
 		 633 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.11 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.95 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.11 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.56 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.11 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.92 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.73 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.89 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.88 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.4 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.5 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.5 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  24 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.06 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.6 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.6 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  23.39 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.94 
 
 		 518 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.49 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.97 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.65 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.26 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  25.17 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.23 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.5 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.43 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.48 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.48 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.29 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.68 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.69 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  24.94 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0375  Outer membrane protein-like  23.23 
 
 		 667 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  21.88 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.25 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  22.92 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  25.26 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  23.26 
 
 		 574 aa  71.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  25.26 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  23 
 
 		 574 aa  70.1  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.23 
 
 		 524 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  21.57 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.92 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.89 
 
 		 519 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.82 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.48 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.25 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  22.76 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.67 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  23.43 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3679  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  24.86 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.78 
 
 		 609 aa  67.8  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.6 
 
 		 658 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.31 
 
 		 472 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.31 
 
 		 487 aa  67  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.71 
 
 		 566 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>