More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2905 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  100 
 
 
469 aa  956    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  98.51 
 
 
469 aa  940    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  72.4 
 
 
467 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  98.72 
 
 
469 aa  944    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  98.51 
 
 
469 aa  941    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0829  TolC family type I secretion outer membrane protein  47.33 
 
 
478 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.461433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0805  TolC family type I secretion outer membrane protein  47.33 
 
 
478 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0844  TolC family type I secretion outer membrane protein  47.33 
 
 
478 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4381  TolC family type I secretion outer membrane protein  45.5 
 
 
477 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108825  normal  0.496475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4602  type I secretion outer membrane protein, TolC family  38.63 
 
 
444 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2168  outer membrane efflux protein  31.67 
 
 
459 aa  172  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.280294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  29 
 
 
451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2411  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.562073  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.19 
 
 
470 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3710  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 
564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.4 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  26.7 
 
 
425 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  26.44 
 
 
425 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.83 
 
 
451 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_003296  RS05071  putative outer membrane efflux transmembrane protein  26.88 
 
 
483 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485043  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.28 
 
 
468 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0054  outer membrane efflux protein  25.9 
 
 
520 aa  93.2  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.906913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.21 
 
 
450 aa  93.2  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.9 
 
 
450 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.06 
 
 
501 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.26 
 
 
442 aa  90.9  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.05 
 
 
445 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  23.49 
 
 
437 aa  90.1  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.6 
 
 
469 aa  90.1  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.24 
 
 
457 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25.06 
 
 
469 aa  87.4  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.85 
 
 
456 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.3 
 
 
457 aa  87  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.3 
 
 
463 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  25.63 
 
 
471 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.31 
 
 
636 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  23.91 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  24.69 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.55 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.95 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.11 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.11 
 
 
452 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.11 
 
 
452 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 
472 aa  84  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.56 
 
 
484 aa  84  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.88 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.89 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.73 
 
 
472 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.5 
 
 
473 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.11 
 
 
452 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.5 
 
 
473 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.88 
 
 
633 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.62 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  23.5 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.47 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.6 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.6 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.92 
 
 
452 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.06 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.23 
 
 
431 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.94 
 
 
518 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  25.4 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.26 
 
 
450 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.49 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.74 
 
 
440 aa  77  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.65 
 
 
456 aa  77  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.5 
 
 
443 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.55 
 
 
491 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.48 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.43 
 
 
488 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.48 
 
 
488 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.92 
 
 
466 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.69 
 
 
490 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.11 
 
 
519 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  23.26 
 
 
574 aa  71.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  21.88 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.25 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  22.92 
 
 
461 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.05 
 
 
524 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  23 
 
 
574 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  25.26 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  25.26 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.82 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  24.7 
 
 
492 aa  70.5  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0375  Outer membrane protein-like  23.23 
 
 
667 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.56 
 
 
472 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  21.57 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.92 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.95 
 
 
566 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.25 
 
 
522 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.45 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.25 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 
495 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.31 
 
 
487 aa  67  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  23.43 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3679  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  24.86 
 
 
467 aa  67  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.7 
 
 
478 aa  66.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.46 
 
 
462 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>