293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3710 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3710  outer membrane efflux protein  100 
 
 
564 aa  1119    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_003296  RS05071  putative outer membrane efflux transmembrane protein  75.06 
 
 
483 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485043  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.5 
 
 
470 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0993  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.95 
 
 
475 aa  143  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  28.61 
 
 
451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.29 
 
 
469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.04 
 
 
469 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  26.04 
 
 
469 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.04 
 
 
469 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.07 
 
 
467 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0829  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.09 
 
 
478 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.461433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2168  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 
459 aa  94.7  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.280294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0805  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.05 
 
 
478 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4602  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.19 
 
 
444 aa  90.9  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  25.3 
 
 
425 aa  88.6  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0375  Outer membrane protein-like  24.49 
 
 
667 aa  88.2  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.47 
 
 
472 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4381  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.44 
 
 
477 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108825  normal  0.496475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0844  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.56 
 
 
478 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.13 
 
 
484 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  23.84 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.17 
 
 
466 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  26.19 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.92 
 
 
471 aa  84  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.85 
 
 
501 aa  80.9  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  23.6 
 
 
436 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.22 
 
 
456 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  20.6 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.24 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3147  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 
495 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.51 
 
 
451 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.89 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  22.27 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.21 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.49 
 
 
452 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.98 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.5 
 
 
480 aa  71.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.13 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.74 
 
 
478 aa  70.1  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.99 
 
 
444 aa  70.1  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.21 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2411  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.562073  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.32 
 
 
491 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.84 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  25.44 
 
 
458 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.17 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2274  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.62 
 
 
452 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  23.31 
 
 
452 aa  67.8  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  22.2 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.62 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.29 
 
 
489 aa  67.4  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.15 
 
 
470 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.83 
 
 
468 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 
431 aa  67  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  23.04 
 
 
456 aa  66.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.39 
 
 
463 aa  67  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  26 
 
 
440 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  22.76 
 
 
471 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.49 
 
 
475 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.49 
 
 
463 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  22.98 
 
 
425 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  22.98 
 
 
425 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.9 
 
 
452 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 
419 aa  64.3  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.69 
 
 
470 aa  63.9  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.61 
 
 
518 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  22.62 
 
 
492 aa  63.9  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.59 
 
 
450 aa  63.5  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  24.67 
 
 
435 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.62 
 
 
483 aa  63.5  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  21.32 
 
 
469 aa  63.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  28.03 
 
 
443 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.88 
 
 
460 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.61 
 
 
471 aa  63.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.22 
 
 
471 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.22 
 
 
471 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.39 
 
 
636 aa  62.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.72 
 
 
484 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.31 
 
 
524 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.22 
 
 
522 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.92 
 
 
487 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  26.77 
 
 
415 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  18.85 
 
 
450 aa  62  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.57 
 
 
472 aa  62  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.52 
 
 
473 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.52 
 
 
473 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.41 
 
 
457 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.41 
 
 
456 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.82 
 
 
450 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.52 
 
 
475 aa  61.6  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  24.4 
 
 
456 aa  61.2  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.31 
 
 
519 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.83 
 
 
472 aa  60.8  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.53 
 
 
471 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.19 
 
 
456 aa  60.5  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 
440 aa  59.7  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.75 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  18.9 
 
 
566 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  22.3 
 
 
503 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>