67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3651 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  100 
 
 		 613 aa  1241    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1592  glycoside hydrolase family 76  45.32 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  50 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3987  glycoside hydrolase family 76  27.47 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  38.65 
 
 		 692 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 726 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  54.65 
 
 		 957 aa  99.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  54.65 
 
 		 884 aa  97.8  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6932  glycoside hydrolase family 76  28.02 
 
 		 371 aa  97.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  34.5 
 
 		 484 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  52.38 
 
 		 1187 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2725  glycoside hydrolase family 76  29.53 
 
 		 535 aa  94  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  25.72 
 
 		 615 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  32.84 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5519  glycoside hydrolase family 76  30.99 
 
 		 380 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000740708  normal  0.0122661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3279  glycoside hydrolase family 76  29.56 
 
 		 356 aa  83.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000344629  hitchhiker  0.00665108 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  46.34 
 
 		 465 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5225  glycoside hydrolase family 76  31.87 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2402  glycoside hydrolase family 76  28.26 
 
 		 387 aa  80.1  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000669737  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2597  glycoside hydrolase family 76  30.07 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0608  putative glycosyl hydrolase  26.76 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  24.27 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  29.24 
 
 		 664 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  43.02 
 
 		 1141 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  35.71 
 
 		 955 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0239  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0389  glycoside hydrolase family 76  25.14 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1181  hypothetical protein  27.4 
 
 		 806 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.488758  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  28.47 
 
 		 479 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5961  glycoside hydrolase family 76  23.19 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0505  alpha-1,6-mannanase  29.17 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0737  putative glycosyl hydrolase  25.8 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  44.12 
 
 		 1292 aa  60.8  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2564  glycoside hydrolase family 76  26.56 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.15972  normal  0.0207401 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06472  putative endo mannanase, GH76 family (Eurofung)  25.86 
 
 		 385 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0842136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10370  hypothetical protein  26.32 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0423  hypothetical protein  23.15 
 
 		 806 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0374953  normal  0.0190212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0666  glycoside hydrolase family protein  25.78 
 
 		 370 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1288  beta and gamma crystallin  23.15 
 
 		 806 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  36 
 
 		 541 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  34.48 
 
 		 545 aa  54.3  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  25.71 
 
 		 492 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  36.71 
 
 		 984 aa  53.5  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1002  glycoside hydrolase family protein  27.09 
 
 		 425 aa  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.508727 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  35.62 
 
 		 655 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0496  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 387 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.66633 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0474  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 387 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0485  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 387 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 		 536 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2114  hypothetical protein  24.31 
 
 		 549 aa  50.4  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.204968 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  38.57 
 
 		 1441 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  38.03 
 
 		 394 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0346  hypothetical protein  24.67 
 
 		 569 aa  48.5  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0547  hypothetical protein  38.96 
 
 		 112 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  30.21 
 
 		 1332 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  37.5 
 
 		 717 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  23.16 
 
 		 1295 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1024 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  26.5 
 
 		 1275 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  34.78 
 
 		 654 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0616  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.45 
 
 		 20646 aa  45.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  27.47 
 
 		 874 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1093 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  35.06 
 
 		 1048 aa  44.3  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  28.41 
 
 		 1070 aa  44.3  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  34.94 
 
 		 1108 aa  43.9  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  30 
 
 		 1302 aa  43.9  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>