More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3194 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 905 aa  1867    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  49.83 
 
 		 901 aa  863    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  51.32 
 
 		 884 aa  943    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  50.18 
 
 		 800 aa  773    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  53.66 
 
 		 799 aa  847    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  53.13 
 
 		 609 aa  638    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  52.39 
 
 		 757 aa  695    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  45.59 
 
 		 614 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  42.48 
 
 		 614 aa  515  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.73 
 
 		 620 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  43.04 
 
 		 603 aa  502  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  42.59 
 
 		 640 aa  496  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  43.43 
 
 		 980 aa  469  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  42.08 
 
 		 864 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  43.2 
 
 		 575 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.91 
 
 		 623 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  40.26 
 
 		 584 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  37.21 
 
 		 626 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.97 
 
 		 1064 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.84 
 
 		 932 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  39.48 
 
 		 600 aa  393  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.82 
 
 		 619 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  39.16 
 
 		 602 aa  383  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  36.32 
 
 		 613 aa  322  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  34.17 
 
 		 590 aa  301  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  34.49 
 
 		 627 aa  285  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.92 
 
 		 640 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 		 593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.79 
 
 		 614 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.12 
 
 		 595 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.81 
 
 		 621 aa  254  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  32.6 
 
 		 623 aa  253  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.31 
 
 		 614 aa  242  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  31.24 
 
 		 645 aa  241  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.62 
 
 		 892 aa  238  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  28.99 
 
 		 889 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.5 
 
 		 604 aa  224  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  30.18 
 
 		 945 aa  220  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  30.39 
 
 		 651 aa  217  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.99 
 
 		 710 aa  216  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.79 
 
 		 923 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.23 
 
 		 619 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2461  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.57 
 
 		 929 aa  126  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.02 
 
 		 940 aa  120  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  29.54 
 
 		 804 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  28.73 
 
 		 804 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  29.4 
 
 		 824 aa  111  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.49 
 
 		 686 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 		 925 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  24.79 
 
 		 601 aa  109  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.01 
 
 		 738 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 951 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.39 
 
 		 984 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.94 
 
 		 750 aa  104  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 		 803 aa  104  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.39 
 
 		 785 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  27.78 
 
 		 815 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3212  hypothetical protein  34.12 
 
 		 198 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4083  glycoside hydrolase family protein  28.24 
 
 		 832 aa  99.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3244  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 916 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  25.18 
 
 		 1171 aa  99  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  25.11 
 
 		 596 aa  98.6  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.49 
 
 		 858 aa  97.8  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3487  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.46 
 
 		 748 aa  97.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.44 
 
 		 972 aa  96.3  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.03 
 
 		 862 aa  95.9  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.42 
 
 		 1053 aa  95.9  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  25.69 
 
 		 837 aa  95.5  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3782  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.34 
 
 		 747 aa  95.9  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  27.27 
 
 		 894 aa  95.5  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  27.39 
 
 		 707 aa  95.5  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 888 aa  95.1  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  25.19 
 
 		 928 aa  94.7  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4133  glycoside hydrolase family protein  28.46 
 
 		 754 aa  94.7  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  26.74 
 
 		 717 aa  94.4  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  24.94 
 
 		 734 aa  94  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  24.52 
 
 		 597 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1810  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.66 
 
 		 794 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00809991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.75 
 
 		 743 aa  93.6  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.22 
 
 		 986 aa  92  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  24.41 
 
 		 607 aa  91.3  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  26.65 
 
 		 704 aa  91.3  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 		 1015 aa  90.9  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  25.45 
 
 		 603 aa  90.9  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  25.05 
 
 		 600 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 		 1175 aa  90.9  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.36 
 
 		 811 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.83 
 
 		 1329 aa  90.5  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  26.29 
 
 		 568 aa  90.1  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  24.1 
 
 		 1084 aa  89.7  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  26.11 
 
 		 932 aa  90.1  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.77 
 
 		 808 aa  89.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  25.23 
 
 		 1063 aa  88.6  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.36 
 
 		 837 aa  89  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  23.94 
 
 		 1019 aa  88.2  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3160  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 1185 aa  88.2  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.24 
 
 		 1033 aa  88.2  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  22.63 
 
 		 1076 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2700  Beta-galactosidase  23.94 
 
 		 848 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000378241  normal  0.397467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.13 
 
 		 805 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>