More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0244 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0244  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 208 aa  438  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0661  polysaccharide deacetylase  54.31 
 
 		 205 aa  231  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  46.41 
 
 		 215 aa  201  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1625  polysaccharide deacetylase  45.02 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.679944  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2175  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  41.43 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5477  polysaccharide deacetylase  44.93 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  43.87 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  40.61 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.36 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  37.77 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  38.41 
 
 		 259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  37.23 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  37.23 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  33.51 
 
 		 425 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 277 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 305 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  37.11 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 		 275 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  38.22 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  32.81 
 
 		 417 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3931  polysaccharide deacetylase  36.96 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 302 aa  101  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  40.22 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 251 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  32.57 
 
 		 430 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  34.76 
 
 		 372 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 413 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  33.67 
 
 		 349 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 		 275 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 		 291 aa  99  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 		 275 aa  98.6  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 		 275 aa  98.6  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 		 275 aa  98.6  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 		 275 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  35.91 
 
 		 258 aa  98.6  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  30.32 
 
 		 251 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  33.76 
 
 		 479 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1551  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 243 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 258 aa  96.7  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  35.22 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  35.22 
 
 		 275 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  34.62 
 
 		 479 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3879  polysaccharide deacetylase  34.42 
 
 		 289 aa  95.9  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  34.59 
 
 		 275 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.69 
 
 		 481 aa  95.1  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  32.02 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1515  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.416831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  32.91 
 
 		 299 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0900  polysaccharide deacetylase  36.48 
 
 		 246 aa  94  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 		 317 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 		 392 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1978  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 		 240 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  32.28 
 
 		 256 aa  93.2  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  33.75 
 
 		 301 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  32.78 
 
 		 267 aa  92.8  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  31.35 
 
 		 413 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  29.35 
 
 		 232 aa  91.7  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  34.39 
 
 		 387 aa  91.3  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1185  polysaccharide deacetylase  32.08 
 
 		 409 aa  91.7  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1834  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 		 397 aa  91.3  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  29.51 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  37.42 
 
 		 320 aa  90.9  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  32.83 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5037  polysaccharide deacetylase  28.64 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0408  peptidoglycan GlcNAc deacetylase  30 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  31.19 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 752 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 259 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  30.86 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  31.03 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 258 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  33.67 
 
 		 300 aa  89  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  30.11 
 
 		 321 aa  88.6  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  32.98 
 
 		 368 aa  88.6  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  31.64 
 
 		 279 aa  88.6  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 522 aa  88.2  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6465  polysaccharide deacetylase  33.14 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  33.75 
 
 		 488 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  31.67 
 
 		 272 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 503 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1462  polysaccharide deacetylase  31.64 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  32.07 
 
 		 364 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 		 289 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1081  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  29.19 
 
 		 468 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  32.31 
 
 		 1120 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>