128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0057 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  100 
 
 
827 aa  1668    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  27.4 
 
 
992 aa  152  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  33.42 
 
 
1051 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  35.33 
 
 
565 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
1711 aa  134  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 
994 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.57 
 
 
1007 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
1276 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
1247 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
1779 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  28.66 
 
 
1219 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
1276 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
1192 aa  109  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  30.81 
 
 
371 aa  107  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  28.79 
 
 
521 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  29.01 
 
 
1058 aa  98.6  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 
846 aa  98.2  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  33.91 
 
 
717 aa  90.1  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  30.59 
 
 
903 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.04 
 
 
1266 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
868 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 
1621 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
916 aa  85.1  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 
729 aa  83.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.1 
 
 
2741 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  29.48 
 
 
1096 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.87 
 
 
2637 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  30.27 
 
 
1228 aa  80.5  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 
2741 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  27.91 
 
 
1241 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.34 
 
 
809 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.6 
 
 
1162 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
1162 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.31 
 
 
1009 aa  77.8  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  26.92 
 
 
532 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
883 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.62 
 
 
3299 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  25.99 
 
 
845 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  29.71 
 
 
1104 aa  73.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  27.13 
 
 
1363 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 
1544 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  25 
 
 
997 aa  72.4  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5663  hypothetical protein  37.08 
 
 
960 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.937261  normal  0.177848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
1448 aa  72.8  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.16 
 
 
1186 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.34 
 
 
3535 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.34 
 
 
3419 aa  72  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.73 
 
 
3298 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.34 
 
 
3537 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  32.75 
 
 
595 aa  71.6  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  25.08 
 
 
1476 aa  71.2  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  31.16 
 
 
874 aa  70.5  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  24.18 
 
 
853 aa  69.7  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  32.88 
 
 
1077 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  34.56 
 
 
873 aa  67.8  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  31.43 
 
 
1142 aa  67.8  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  35.64 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.94 
 
 
1650 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  29.79 
 
 
960 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  28.49 
 
 
840 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
822 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
851 aa  65.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  27.44 
 
 
891 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03525  conserved hypothetical protein  30.18 
 
 
747 aa  65.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125574  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6582  hypothetical protein  26.42 
 
 
1076 aa  64.7  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
905 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
905 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
880 aa  63.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  33.14 
 
 
811 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  36.43 
 
 
897 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  33.16 
 
 
553 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  37.06 
 
 
890 aa  62.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
796 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  24.16 
 
 
944 aa  61.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
868 aa  60.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  24.17 
 
 
884 aa  60.8  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  26.57 
 
 
1171 aa  60.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00481  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 
1114 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.846176  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.78 
 
 
1772 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.65 
 
 
1328 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
949 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  32.42 
 
 
909 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  40.15 
 
 
883 aa  59.7  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 
885 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.93 
 
 
919 aa  58.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  38.14 
 
 
890 aa  58.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  29.13 
 
 
751 aa  58.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  40.38 
 
 
1441 aa  58.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  28.83 
 
 
950 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  28.83 
 
 
950 aa  57.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 
902 aa  57.4  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
854 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.99 
 
 
957 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  34.88 
 
 
814 aa  56.2  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 
1215 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  24.42 
 
 
1247 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  31.11 
 
 
121 aa  55.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  25.66 
 
 
989 aa  55.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  32.5 
 
 
689 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>