64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1697 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  100 
 
 
1461 aa  3024    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  34.64 
 
 
2602 aa  670    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0183  putative lipoprotein  22.84 
 
 
2204 aa  150  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  34.48 
 
 
2478 aa  131  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  41.4 
 
 
2267 aa  125  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  44 
 
 
2487 aa  87.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  37.27 
 
 
1665 aa  83.2  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  42 
 
 
3191 aa  82.8  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  44.21 
 
 
3737 aa  77.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  44.32 
 
 
3602 aa  75.5  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  30.73 
 
 
2005 aa  72.4  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  39.53 
 
 
2927 aa  70.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  36.61 
 
 
2588 aa  70.5  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  37.78 
 
 
2296 aa  68.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  41.98 
 
 
1526 aa  67.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  36.67 
 
 
750 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  44.87 
 
 
4896 aa  65.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  34.91 
 
 
676 aa  65.1  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  29.52 
 
 
1162 aa  65.1  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  37.89 
 
 
1066 aa  64.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  38.55 
 
 
3793 aa  63.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  34.78 
 
 
1059 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  38.36 
 
 
1371 aa  62.4  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  32.61 
 
 
2772 aa  62.4  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  36.54 
 
 
1139 aa  62.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.01 
 
 
3227 aa  62.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  39.53 
 
 
599 aa  60.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  44.44 
 
 
2377 aa  60.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  33.03 
 
 
1483 aa  60.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  33.02 
 
 
315 aa  60.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  32.61 
 
 
2421 aa  60.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  32.61 
 
 
2454 aa  60.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  32.61 
 
 
2367 aa  59.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  32.61 
 
 
2807 aa  59.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  32.61 
 
 
2411 aa  59.7  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  36.14 
 
 
815 aa  59.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  25.45 
 
 
1259 aa  58.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  33.7 
 
 
2064 aa  58.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  41.67 
 
 
627 aa  57.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  30.77 
 
 
852 aa  55.1  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  35.42 
 
 
1547 aa  54.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  30.56 
 
 
822 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  31.25 
 
 
2022 aa  52.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  41.43 
 
 
561 aa  52.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  40.51 
 
 
3324 aa  52.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  30.39 
 
 
637 aa  52.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  47.46 
 
 
3927 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  30.86 
 
 
1345 aa  51.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  34.78 
 
 
794 aa  51.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  42.37 
 
 
4013 aa  51.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  23.87 
 
 
535 aa  50.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  25.78 
 
 
1064 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  34.18 
 
 
540 aa  50.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  29.75 
 
 
799 aa  50.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  32.63 
 
 
871 aa  49.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  38.03 
 
 
1111 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  27.19 
 
 
1389 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  33.61 
 
 
742 aa  47  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27.23 
 
 
1969 aa  47  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  32.47 
 
 
3471 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  33.33 
 
 
1193 aa  45.8  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  32.97 
 
 
1313 aa  45.4  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  26.55 
 
 
2207 aa  45.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  29.78 
 
 
4429 aa  45.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>