More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0486 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 965 aa  1982    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0297  TPR repeat-containing protein  69.57 
 
 		 922 aa  1291    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.276018  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1954  ATPase  37.23 
 
 		 673 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342143  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1789  hypothetical protein  37.22 
 
 		 581 aa  259  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0254074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2442  ATPase  34.74 
 
 		 756 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0026  hypothetical protein  33.42 
 
 		 692 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0710  pentatricopeptide repeat containing protein  26.05 
 
 		 932 aa  163  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0248  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 793 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1120  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 		 523 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  41.8 
 
 		 685 aa  116  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 		 681 aa  113  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  43.21 
 
 		 560 aa  111  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1875  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 813 aa  111  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 362 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.4 
 
 		 810 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 543 aa  108  6e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 1276 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 637 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  36.84 
 
 		 714 aa  105  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.84 
 
 		 878 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 		 714 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.81 
 
 		 632 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  38.39 
 
 		 649 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  38.39 
 
 		 649 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 		 909 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  43.02 
 
 		 1694 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  38.74 
 
 		 646 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  34.03 
 
 		 603 aa  101  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  34.39 
 
 		 865 aa  100  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 927 aa  99.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 583 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  37.02 
 
 		 3035 aa  97.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  37.57 
 
 		 3560 aa  97.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 833 aa  97.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  37.42 
 
 		 1094 aa  96.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 739 aa  96.3  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  34.74 
 
 		 816 aa  93.6  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 750 aa  93.2  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 612 aa  92.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  35.84 
 
 		 512 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  37.99 
 
 		 725 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 4489 aa  90.5  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.82 
 
 		 397 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 523 aa  87.4  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  36.84 
 
 		 1507 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  31.84 
 
 		 795 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 356 aa  87  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 804 aa  85.9  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.39 
 
 		 576 aa  85.1  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  34.39 
 
 		 573 aa  84.7  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  33.5 
 
 		 732 aa  84.7  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 602 aa  84.7  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  31.98 
 
 		 764 aa  84.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 542 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  33.51 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 363 aa  82.8  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  34.72 
 
 		 623 aa  82  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.07 
 
 		 622 aa  81.6  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 711 aa  81.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  33 
 
 		 582 aa  80.9  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 589 aa  79.7  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 911 aa  79.7  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.69 
 
 		 626 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.69 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.69 
 
 		 626 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 639 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.69 
 
 		 614 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  44.19 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 653 aa  78.2  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  33.54 
 
 		 653 aa  78.2  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 		 4079 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 955 aa  77.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 562 aa  77  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 486 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 444 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 620 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 824 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  27.43 
 
 		 670 aa  75.9  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.44 
 
 		 1007 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 3301 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.93 
 
 		 1022 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.47 
 
 		 887 aa  75.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 635 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 635 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 847 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  34 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 649 aa  75.1  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.57 
 
 		 730 aa  74.7  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 740 aa  74.7  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>