157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0380 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  46.1 
 
 		 1636 aa  885    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  43.24 
 
 		 1847 aa  744    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 1301 aa  2702    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  46.28 
 
 		 1063 aa  848    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  42.81 
 
 		 1560 aa  768    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  48.82 
 
 		 1613 aa  910    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  43.76 
 
 		 1609 aa  799    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  44.72 
 
 		 1615 aa  796    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  45.45 
 
 		 1632 aa  837    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  33.85 
 
 		 977 aa  333  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  33.43 
 
 		 1341 aa  318  4e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  30.22 
 
 		 1004 aa  294  8e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  32.41 
 
 		 921 aa  272  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  42.62 
 
 		 301 aa  235  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  37.14 
 
 		 1005 aa  164  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  36.18 
 
 		 1024 aa  164  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  35.98 
 
 		 1021 aa  164  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  29.01 
 
 		 871 aa  144  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  58.46 
 
 		 576 aa  91.7  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  25 
 
 		 811 aa  75.1  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  26.53 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  23.23 
 
 		 899 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  22.84 
 
 		 875 aa  67.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  24.88 
 
 		 815 aa  67.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  23.57 
 
 		 899 aa  68.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1098 aa  67  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  30.82 
 
 		 1047 aa  66.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  28.12 
 
 		 1049 aa  65.1  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  27.32 
 
 		 1064 aa  64.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  24.88 
 
 		 815 aa  64.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  21.8 
 
 		 800 aa  63.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  23.14 
 
 		 770 aa  63.2  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  32.26 
 
 		 1059 aa  62.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  23.27 
 
 		 1053 aa  62  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  25.64 
 
 		 1116 aa  61.6  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  22.36 
 
 		 489 aa  61.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  28.48 
 
 		 1125 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  22.58 
 
 		 770 aa  60.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  21.55 
 
 		 489 aa  60.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  30.7 
 
 		 1176 aa  60.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  23.35 
 
 		 993 aa  60.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  23.94 
 
 		 829 aa  59.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  22 
 
 		 793 aa  59.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0964  helicase domain-containing protein  36.05 
 
 		 84 aa  59.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.317266  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  23.1 
 
 		 825 aa  58.9  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  22.56 
 
 		 780 aa  58.9  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  21.04 
 
 		 787 aa  58.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  22.33 
 
 		 907 aa  57.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  22.45 
 
 		 787 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  22.42 
 
 		 469 aa  57.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  19.67 
 
 		 560 aa  57.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  22.03 
 
 		 967 aa  57  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  23.81 
 
 		 813 aa  57.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  22.22 
 
 		 791 aa  57  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  21.61 
 
 		 912 aa  56.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  21.41 
 
 		 706 aa  56.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  23.47 
 
 		 946 aa  57  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  22.1 
 
 		 783 aa  56.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  23.24 
 
 		 824 aa  56.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  23.21 
 
 		 951 aa  55.5  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  24.82 
 
 		 979 aa  55.5  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  22.33 
 
 		 760 aa  55.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  21.99 
 
 		 796 aa  55.5  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  20.14 
 
 		 827 aa  55.5  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  21.36 
 
 		 974 aa  55.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  21.15 
 
 		 810 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  23.67 
 
 		 817 aa  54.3  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  29.6 
 
 		 848 aa  54.3  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  19.77 
 
 		 765 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  24.45 
 
 		 824 aa  54.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  22.02 
 
 		 784 aa  53.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  22.02 
 
 		 784 aa  53.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  22.51 
 
 		 780 aa  53.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  22.68 
 
 		 783 aa  53.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  22.09 
 
 		 760 aa  53.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  21.88 
 
 		 949 aa  53.5  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  21.76 
 
 		 788 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  21.36 
 
 		 629 aa  53.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  22.5 
 
 		 797 aa  53.1  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  23.39 
 
 		 813 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  21.26 
 
 		 821 aa  52.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.13 
 
 		 1188 aa  52.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  22.2 
 
 		 802 aa  52  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  21.08 
 
 		 793 aa  52  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  25.53 
 
 		 809 aa  51.6  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  20.97 
 
 		 842 aa  51.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  23.71 
 
 		 492 aa  51.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  27.73 
 
 		 558 aa  51.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  25.27 
 
 		 815 aa  51.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  24.31 
 
 		 905 aa  50.8  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  25.32 
 
 		 539 aa  50.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  21.46 
 
 		 804 aa  50.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  20.56 
 
 		 1149 aa  50.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  21.5 
 
 		 790 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  21.46 
 
 		 475 aa  50.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  22.98 
 
 		 1068 aa  49.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  22.12 
 
 		 574 aa  49.3  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  23.23 
 
 		 1068 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  24.28 
 
 		 812 aa  49.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  29.41 
 
 		 556 aa  49.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>