27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5507 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  65.07 
 
 		 1632 aa  394  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  52.59 
 
 		 1613 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  51.6 
 
 		 1615 aa  267  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  50 
 
 		 1609 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  42.62 
 
 		 1301 aa  235  8e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  43.19 
 
 		 1636 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  44.81 
 
 		 1063 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  40.41 
 
 		 1847 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  42.8 
 
 		 1560 aa  189  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  37.12 
 
 		 977 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  32.06 
 
 		 1004 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  35.36 
 
 		 1341 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  33.83 
 
 		 921 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  32.63 
 
 		 1028 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  34.94 
 
 		 770 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  35.62 
 
 		 817 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  35.62 
 
 		 827 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  38.03 
 
 		 800 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  38.36 
 
 		 783 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  39.19 
 
 		 776 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  25.4 
 
 		 237 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  35.14 
 
 		 842 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  33.62 
 
 		 706 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  37.14 
 
 		 770 aa  42.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  33.77 
 
 		 824 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  35.21 
 
 		 813 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>