28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0310 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  100 
 
 
1116 aa  2235    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  53.07 
 
 
1047 aa  1004    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  33.51 
 
 
1098 aa  633  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  32.54 
 
 
1059 aa  545  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  31.14 
 
 
1049 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  31.34 
 
 
1064 aa  494  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  21.47 
 
 
1100 aa  192  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  24.32 
 
 
1021 aa  191  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  23.1 
 
 
1176 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  26.42 
 
 
1024 aa  174  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  24 
 
 
1615 aa  164  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  23.63 
 
 
1636 aa  163  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  24.25 
 
 
1125 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  20.69 
 
 
1121 aa  160  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  25.6 
 
 
1560 aa  159  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  24.75 
 
 
1613 aa  158  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  21.66 
 
 
1609 aa  155  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  25.72 
 
 
1005 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  23.52 
 
 
1632 aa  142  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  22.44 
 
 
1847 aa  117  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  22.49 
 
 
576 aa  92.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  19.35 
 
 
555 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  24.94 
 
 
475 aa  65.1  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  24.1 
 
 
1063 aa  62  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  25.64 
 
 
1301 aa  61.6  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2332  adenine specific DNA methyltransferase  33.68 
 
 
151 aa  56.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0118621 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  38.24 
 
 
1058 aa  47.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  28.05 
 
 
710 aa  46.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>