22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0378 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  100 
 
 
475 aa  984    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  43.6 
 
 
1609 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  43 
 
 
1636 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  42.63 
 
 
576 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  38.7 
 
 
1615 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  37.24 
 
 
1613 aa  346  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  36.86 
 
 
1560 aa  308  9e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  36.4 
 
 
1632 aa  305  9.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  37.58 
 
 
1024 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  36.07 
 
 
1847 aa  280  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  33.96 
 
 
1021 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  30.51 
 
 
1005 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1350  hypothetical protein  45.32 
 
 
221 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.588656  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0066  hypothetical protein  46.51 
 
 
165 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  24.32 
 
 
1059 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  24.94 
 
 
1116 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  21.25 
 
 
1098 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  27.34 
 
 
1064 aa  57  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  26.85 
 
 
1047 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  27.27 
 
 
1125 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  27.32 
 
 
1049 aa  53.5  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  19.27 
 
 
555 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>