23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3139 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  57.09 
 
 
1636 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  100 
 
 
576 aa  1204    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  46.65 
 
 
1609 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  39.78 
 
 
1615 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  38.79 
 
 
1613 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  42.63 
 
 
475 aa  392  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  38.13 
 
 
1560 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  37.59 
 
 
1847 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  38.72 
 
 
1632 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  35.08 
 
 
1024 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  31.79 
 
 
1021 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  31.67 
 
 
1005 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0066  hypothetical protein  62.8 
 
 
165 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1350  hypothetical protein  35.29 
 
 
221 aa  134  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.588656  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  24.11 
 
 
1049 aa  93.2  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  22.49 
 
 
1116 aa  92.8  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  58.46 
 
 
1301 aa  91.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  23.68 
 
 
1098 aa  84  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  23.44 
 
 
1064 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  20.74 
 
 
1059 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  22.01 
 
 
1047 aa  69.7  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  21.58 
 
 
1125 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  19.76 
 
 
555 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>