35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0925 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  100 
 
 		 1049 aa  2173    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  40.59 
 
 		 1098 aa  766    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  47.66 
 
 		 1059 aa  974    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  59.14 
 
 		 1064 aa  1256    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  31.14 
 
 		 1116 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  29.46 
 
 		 1047 aa  452  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  25.39 
 
 		 1125 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  25.27 
 
 		 1100 aa  201  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  27.87 
 
 		 1024 aa  177  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  26.63 
 
 		 1021 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  25.43 
 
 		 1121 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  22.29 
 
 		 1560 aa  165  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  24.02 
 
 		 1636 aa  158  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  23.42 
 
 		 1176 aa  154  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  25.13 
 
 		 1613 aa  147  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  22.83 
 
 		 1615 aa  131  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  23.54 
 
 		 1005 aa  131  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  22.7 
 
 		 1632 aa  127  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  23.64 
 
 		 1609 aa  124  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  23.16 
 
 		 1847 aa  115  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  24.11 
 
 		 576 aa  93.2  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  23.16 
 
 		 1063 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  23.72 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2332  adenine specific DNA methyltransferase  33.33 
 
 		 151 aa  67.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0118621 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  28.12 
 
 		 1301 aa  65.1  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  27.2 
 
 		 1058 aa  53.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  27.32 
 
 		 475 aa  53.5  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  24.06 
 
 		 908 aa  50.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  30.43 
 
 		 1132 aa  49.3  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1209 aa  48.5  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  30.63 
 
 		 1432 aa  48.1  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  22.73 
 
 		 1041 aa  48.1  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24 
 
 		 974 aa  46.6  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1338 aa  47.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  26.78 
 
 		 1076 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>