139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4323 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  45.16 
 
 		 1636 aa  1415    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  48.82 
 
 		 1301 aa  910    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  51.22 
 
 		 1063 aa  1048    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  42.31 
 
 		 1560 aa  1242    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 1613 aa  3330    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  45.05 
 
 		 1609 aa  1427    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  45.76 
 
 		 1615 aa  1399    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  50.64 
 
 		 1632 aa  1536    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  43.12 
 
 		 1847 aa  1261    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  35.17 
 
 		 1024 aa  540  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  35.33 
 
 		 1021 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  31.84 
 
 		 1005 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  38.79 
 
 		 576 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  37.24 
 
 		 475 aa  346  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  34.02 
 
 		 1341 aa  330  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  34.29 
 
 		 977 aa  323  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  31.92 
 
 		 1004 aa  297  1e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  32.05 
 
 		 921 aa  285  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  52.59 
 
 		 301 aa  273  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1350  hypothetical protein  46.39 
 
 		 221 aa  169  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.588656  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  33.07 
 
 		 871 aa  167  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  24.75 
 
 		 1116 aa  158  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  25.13 
 
 		 1049 aa  147  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0066  hypothetical protein  44.72 
 
 		 165 aa  142  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  23.43 
 
 		 1047 aa  130  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  23.78 
 
 		 1059 aa  128  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1098 aa  127  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  23.53 
 
 		 1125 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  23.98 
 
 		 1176 aa  109  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  25.38 
 
 		 1064 aa  102  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  23.88 
 
 		 1100 aa  85.5  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  22.98 
 
 		 974 aa  83.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  24.55 
 
 		 1121 aa  73.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  23.46 
 
 		 1053 aa  71.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  23.95 
 
 		 1028 aa  67.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  22.5 
 
 		 800 aa  65.9  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  23.11 
 
 		 810 aa  65.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  23.04 
 
 		 1149 aa  63.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  22.93 
 
 		 459 aa  63.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4614  EcoEI R domain-containing protein  23.02 
 
 		 790 aa  64.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000837819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  22.2 
 
 		 825 aa  64.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  21.74 
 
 		 824 aa  63.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  27.5 
 
 		 815 aa  63.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  22.51 
 
 		 788 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  22.12 
 
 		 829 aa  62  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  24.75 
 
 		 706 aa  62  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  21.68 
 
 		 787 aa  61.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  23.09 
 
 		 793 aa  61.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  23.76 
 
 		 815 aa  61.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  33.05 
 
 		 462 aa  61.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  21.91 
 
 		 967 aa  61.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  21.56 
 
 		 492 aa  60.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1134  EcoEI R domain-containing protein  22.22 
 
 		 780 aa  61.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  22.1 
 
 		 796 aa  60.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  22.9 
 
 		 821 aa  59.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  22.79 
 
 		 784 aa  60.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  22.79 
 
 		 784 aa  60.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  22.57 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  22.79 
 
 		 780 aa  59.7  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  21.15 
 
 		 813 aa  59.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  22.2 
 
 		 783 aa  59.3  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02070  type I restriction enzyme EcoAI R protein  22.79 
 
 		 793 aa  58.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  23.09 
 
 		 770 aa  58.5  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  22.25 
 
 		 489 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  27.27 
 
 		 811 aa  57.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  27.45 
 
 		 581 aa  57.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  22.3 
 
 		 953 aa  57.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  22.3 
 
 		 953 aa  57.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  22.49 
 
 		 489 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  26.69 
 
 		 824 aa  57.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  22.35 
 
 		 809 aa  57.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.18 
 
 		 504 aa  57  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  21.55 
 
 		 765 aa  57  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  22.22 
 
 		 993 aa  56.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  24.67 
 
 		 893 aa  56.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  20.09 
 
 		 761 aa  56.6  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  25.1 
 
 		 813 aa  56.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  26.64 
 
 		 817 aa  56.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  22.86 
 
 		 946 aa  56.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  26.64 
 
 		 827 aa  56.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  23.7 
 
 		 770 aa  56.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  28.46 
 
 		 469 aa  54.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  31.3 
 
 		 1287 aa  53.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  23.16 
 
 		 1068 aa  53.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  23.35 
 
 		 938 aa  53.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  25.9 
 
 		 606 aa  53.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  22.45 
 
 		 493 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  21.02 
 
 		 732 aa  53.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  22.46 
 
 		 453 aa  53.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0964  helicase domain-containing protein  35.44 
 
 		 84 aa  53.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.317266  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  25 
 
 		 773 aa  52.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  21.76 
 
 		 1005 aa  52.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  21.68 
 
 		 787 aa  52.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  25.29 
 
 		 776 aa  52.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  23 
 
 		 1068 aa  52.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  21.4 
 
 		 804 aa  52.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  23.15 
 
 		 1051 aa  52.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  23.75 
 
 		 1017 aa  52.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  23.73 
 
 		 1063 aa  52  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 		 1052 aa  52  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>