122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5505 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  100 
 
 		 871 aa  1759    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1341 aa  315  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  29.44 
 
 		 1004 aa  313  9e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  27.76 
 
 		 977 aa  294  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  26.25 
 
 		 921 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  33.16 
 
 		 1613 aa  175  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  33.5 
 
 		 1847 aa  174  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  33.42 
 
 		 1063 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  31.87 
 
 		 1636 aa  163  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  33.7 
 
 		 1632 aa  162  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1604  helicase-associated  28.46 
 
 		 1256 aa  160  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  30.99 
 
 		 1560 aa  156  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  31.82 
 
 		 1615 aa  156  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  30.14 
 
 		 1301 aa  154  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  30.11 
 
 		 1609 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2676  helicase-associated  34.43 
 
 		 222 aa  97.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00131855  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46291  predicted protein  27.42 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49663  predicted protein  29.63 
 
 		 567 aa  82.8  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4408  helicase-associated  27.72 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43902  predicted protein  29.21 
 
 		 1416 aa  71.2  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279249  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44572  predicted protein  28.19 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.709299  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15859  predicted protein  31.03 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575833  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42568  predicted protein  33.33 
 
 		 499 aa  68.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_6725  predicted protein  32.78 
 
 		 168 aa  68.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2675  helicase-associated  35.29 
 
 		 153 aa  67.4  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00741128  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48597  predicted protein  32.9 
 
 		 548 aa  67.4  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45516  predicted protein  26.92 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43489  predicted protein  24.15 
 
 		 425 aa  63.9  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0573784  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  24.15 
 
 		 797 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43867  predicted protein  26.34 
 
 		 485 aa  63.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0425641  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  27.36 
 
 		 1031 aa  61.6  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49441  predicted protein  26.12 
 
 		 1045 aa  61.2  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0740088  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16063  predicted protein  33.33 
 
 		 134 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42569  predicted protein  29.33 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.191925  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  24.14 
 
 		 771 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38634  predicted protein  30.15 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.644785  normal  0.402408 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  24.15 
 
 		 629 aa  58.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6300  predicted protein  27.6 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  23.59 
 
 		 813 aa  57.4  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  25.35 
 
 		 1043 aa  55.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  23.18 
 
 		 815 aa  56.2  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  30.77 
 
 		 842 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7633  predicted protein  35.66 
 
 		 128 aa  55.1  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.23518  hitchhiker  0.00115049 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_6732  predicted protein  27.67 
 
 		 165 aa  55.1  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.798626  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  23.53 
 
 		 585 aa  53.9  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  23.53 
 
 		 585 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6930  helicase-associated  38.89 
 
 		 118 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945725  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  23.53 
 
 		 585 aa  53.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46014  predicted protein  26.29 
 
 		 588 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  26.48 
 
 		 1017 aa  52.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36794  predicted protein  28.19 
 
 		 349 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  24.55 
 
 		 1033 aa  52.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  23.86 
 
 		 770 aa  52.4  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4314  helicase-associated  26.46 
 
 		 288 aa  52.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.273191 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  22.22 
 
 		 1053 aa  52  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  24.19 
 
 		 848 aa  51.6  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  21.63 
 
 		 889 aa  51.6  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  24.42 
 
 		 1029 aa  51.2  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  22.26 
 
 		 952 aa  51.2  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  23.73 
 
 		 812 aa  51.2  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49763  predicted protein  27.81 
 
 		 594 aa  51.2  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  24.13 
 
 		 586 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  26.48 
 
 		 790 aa  50.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  21.87 
 
 		 949 aa  50.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14901  predicted protein  31.11 
 
 		 379 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0674562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  23.78 
 
 		 586 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  23.13 
 
 		 875 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  22.47 
 
 		 949 aa  49.3  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  23.78 
 
 		 586 aa  49.3  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  23.78 
 
 		 586 aa  49.3  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  23.86 
 
 		 586 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  23.86 
 
 		 586 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  23.86 
 
 		 586 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  23.78 
 
 		 586 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  23.78 
 
 		 586 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  23.78 
 
 		 586 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  23.78 
 
 		 586 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4307  helicase-associated  28.65 
 
 		 524 aa  48.9  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.301626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2656  EcoEI R domain protein  24.81 
 
 		 811 aa  48.5  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  23.86 
 
 		 586 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  22.84 
 
 		 987 aa  48.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  23.97 
 
 		 657 aa  47.8  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  23.05 
 
 		 586 aa  47.8  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  23.76 
 
 		 586 aa  47.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  23.68 
 
 		 804 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  24 
 
 		 459 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  23.1 
 
 		 979 aa  47.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  23.02 
 
 		 953 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  23.02 
 
 		 953 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  24.34 
 
 		 550 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  39.34 
 
 		 951 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  23.99 
 
 		 776 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13230  predicted protein  26.92 
 
 		 152 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00796928  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  23.03 
 
 		 946 aa  46.2  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  25.86 
 
 		 462 aa  46.6  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  21.8 
 
 		 586 aa  46.2  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  21.8 
 
 		 770 aa  46.2  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  23.29 
 
 		 584 aa  46.2  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  24.28 
 
 		 586 aa  45.8  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  24.15 
 
 		 783 aa  45.8  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>