164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0602 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0602  helicase, putative  100 
 
 		 1004 aa  2086    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  36.48 
 
 		 1341 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  35.83 
 
 		 977 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  33.96 
 
 		 921 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  31.92 
 
 		 1613 aa  297  7e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  30.22 
 
 		 1301 aa  294  6e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  30.33 
 
 		 1632 aa  280  7e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  31.81 
 
 		 1615 aa  280  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  29.44 
 
 		 1847 aa  271  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  29.46 
 
 		 1636 aa  268  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  30.36 
 
 		 1609 aa  268  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  30.51 
 
 		 1063 aa  266  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  29.3 
 
 		 871 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  29.14 
 
 		 1560 aa  240  9e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1604  helicase-associated  35.47 
 
 		 1256 aa  240  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46291  predicted protein  33.44 
 
 		 501 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6300  predicted protein  40.72 
 
 		 195 aa  156  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15859  predicted protein  38.19 
 
 		 200 aa  154  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575833  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49663  predicted protein  34.76 
 
 		 567 aa  149  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46014  predicted protein  34.24 
 
 		 588 aa  131  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  32.06 
 
 		 301 aa  128  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45516  predicted protein  36.49 
 
 		 349 aa  121  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42568  predicted protein  38.41 
 
 		 499 aa  118  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43489  predicted protein  27.33 
 
 		 425 aa  117  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0573784  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13230  predicted protein  42.25 
 
 		 152 aa  114  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00796928  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44572  predicted protein  30.4 
 
 		 335 aa  110  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.709299  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38634  predicted protein  40.32 
 
 		 146 aa  109  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.644785  normal  0.402408 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36794  predicted protein  38.93 
 
 		 349 aa  108  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42569  predicted protein  31.75 
 
 		 427 aa  105  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.191925  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48597  predicted protein  35.21 
 
 		 548 aa  101  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_6725  predicted protein  33.73 
 
 		 168 aa  96.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49763  predicted protein  34.25 
 
 		 594 aa  95.5  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16063  predicted protein  41.67 
 
 		 134 aa  92  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43867  predicted protein  27.95 
 
 		 485 aa  89.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0425641  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49441  predicted protein  31.28 
 
 		 1045 aa  88.2  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0740088  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43902  predicted protein  32.54 
 
 		 1416 aa  81.3  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279249  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_6732  predicted protein  30.77 
 
 		 165 aa  81.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.798626  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49745  predicted protein  29.61 
 
 		 576 aa  66.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  20.31 
 
 		 952 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7633  predicted protein  33.86 
 
 		 128 aa  65.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.23518  hitchhiker  0.00115049 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  23.67 
 
 		 787 aa  63.9  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  23.52 
 
 		 585 aa  62  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  21.04 
 
 		 469 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  22.76 
 
 		 586 aa  61.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  23.04 
 
 		 993 aa  60.1  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4408  helicase-associated  24.03 
 
 		 302 aa  60.1  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  28.15 
 
 		 1115 aa  58.9  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2675  helicase-associated  30.89 
 
 		 153 aa  58.9  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00741128  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2676  helicase-associated  27.54 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00131855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  23.74 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  22.08 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  22.4 
 
 		 953 aa  57.4  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3077  type III restriction protein res subunit  21.2 
 
 		 980 aa  57.4  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  22.4 
 
 		 953 aa  57.4  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  25 
 
 		 817 aa  56.6  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  23.19 
 
 		 586 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  23.19 
 
 		 586 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  23.19 
 
 		 586 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  23.19 
 
 		 586 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  22.25 
 
 		 949 aa  56.2  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  25 
 
 		 827 aa  56.2  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  23.19 
 
 		 586 aa  56.2  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  22.52 
 
 		 586 aa  56.2  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  22.52 
 
 		 586 aa  56.2  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  22.52 
 
 		 453 aa  55.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  24.47 
 
 		 706 aa  55.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  23.11 
 
 		 744 aa  55.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  28.85 
 
 		 453 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  23.43 
 
 		 586 aa  55.1  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  22.95 
 
 		 586 aa  55.5  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  20.9 
 
 		 1053 aa  55.1  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  22.95 
 
 		 586 aa  54.7  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  22.95 
 
 		 586 aa  54.7  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  22.3 
 
 		 797 aa  54.7  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  22.95 
 
 		 586 aa  54.7  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  23.67 
 
 		 652 aa  54.7  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  21.71 
 
 		 556 aa  54.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  21.87 
 
 		 946 aa  54.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  24.19 
 
 		 449 aa  54.3  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  22.22 
 
 		 469 aa  53.5  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  21.75 
 
 		 1137 aa  53.5  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  22.95 
 
 		 586 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  22.12 
 
 		 585 aa  53.5  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 440 aa  52.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1131 aa  52.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  25 
 
 		 813 aa  52  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  21.17 
 
 		 1137 aa  52  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  25.2 
 
 		 905 aa  51.6  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  23.08 
 
 		 613 aa  51.6  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  22.83 
 
 		 489 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  21.93 
 
 		 1041 aa  50.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0270  DEAD/DEAH box helicase  22.93 
 
 		 790 aa  50.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  24.7 
 
 		 811 aa  50.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  23.32 
 
 		 585 aa  51.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  23.32 
 
 		 585 aa  51.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  21.18 
 
 		 1149 aa  50.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  21.05 
 
 		 657 aa  50.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  23.32 
 
 		 585 aa  50.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  24.19 
 
 		 824 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  24.14 
 
 		 1169 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>