26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43489 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43489  predicted protein  100 
 
 
425 aa  890    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0573784  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  27.33 
 
 
1004 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6300  predicted protein  34.76 
 
 
195 aa  109  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1604  helicase-associated  31.67 
 
 
1256 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46291  predicted protein  36.81 
 
 
501 aa  106  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15859  predicted protein  34.63 
 
 
200 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575833  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45516  predicted protein  32.73 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42568  predicted protein  33.33 
 
 
499 aa  86.7  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49663  predicted protein  30.56 
 
 
567 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36794  predicted protein  33.33 
 
 
349 aa  84  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49763  predicted protein  32.41 
 
 
594 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48597  predicted protein  32.69 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13230  predicted protein  32.61 
 
 
152 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00796928  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_6725  predicted protein  30.51 
 
 
168 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44572  predicted protein  26.38 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.709299  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42569  predicted protein  32.64 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.191925  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46014  predicted protein  25.81 
 
 
588 aa  73.6  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43902  predicted protein  30 
 
 
1416 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279249  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43867  predicted protein  24.77 
 
 
485 aa  64.7  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0425641  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_6732  predicted protein  32 
 
 
165 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.798626  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  23.2 
 
 
1341 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  22.95 
 
 
977 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  24.77 
 
 
921 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38634  predicted protein  26.21 
 
 
146 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.644785  normal  0.402408 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  30.25 
 
 
871 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16063  predicted protein  26.25 
 
 
134 aa  49.7  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>