30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42568 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42568  predicted protein  100 
 
 
499 aa  1030    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42569  predicted protein  53.49 
 
 
427 aa  299  6e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.191925  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15859  predicted protein  41.45 
 
 
200 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575833  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48597  predicted protein  32.39 
 
 
548 aa  121  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45516  predicted protein  31.36 
 
 
349 aa  120  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13230  predicted protein  39.46 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00796928  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  38.41 
 
 
1004 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49663  predicted protein  39.44 
 
 
567 aa  113  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36794  predicted protein  39.61 
 
 
349 aa  113  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46291  predicted protein  35.81 
 
 
501 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_6725  predicted protein  37.93 
 
 
168 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6300  predicted protein  35.86 
 
 
195 aa  104  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49763  predicted protein  34.23 
 
 
594 aa  104  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43902  predicted protein  33.55 
 
 
1416 aa  95.9  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279249  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46014  predicted protein  29.63 
 
 
588 aa  94  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43867  predicted protein  34.44 
 
 
485 aa  94.4  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0425641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1604  helicase-associated  32.89 
 
 
1256 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_6732  predicted protein  31.82 
 
 
165 aa  90.1  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.798626  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44572  predicted protein  33.55 
 
 
335 aa  87.8  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.709299  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43489  predicted protein  33.33 
 
 
425 aa  87.4  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0573784  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38634  predicted protein  33.56 
 
 
146 aa  83.6  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.644785  normal  0.402408 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  31.93 
 
 
921 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  32.26 
 
 
1341 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16063  predicted protein  32.45 
 
 
134 aa  67  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43808  predicted protein  27.22 
 
 
271 aa  54.7  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49745  predicted protein  24.68 
 
 
576 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  27.39 
 
 
977 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  30.49 
 
 
951 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_7633  predicted protein  24.49 
 
 
128 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.23518  hitchhiker  0.00115049 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  30.61 
 
 
871 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>