109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0578 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  46.16 
 
 		 1632 aa  1409    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  46.47 
 
 		 1636 aa  1441    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  43.86 
 
 		 1301 aa  808    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  47.56 
 
 		 1063 aa  932    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  39.27 
 
 		 1560 aa  1173    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  45.11 
 
 		 1613 aa  1435    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 1609 aa  3340    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  63.44 
 
 		 1615 aa  2128    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  44.49 
 
 		 1847 aa  1331    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  36.03 
 
 		 1024 aa  580  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  35.08 
 
 		 1021 aa  525  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  46.65 
 
 		 576 aa  513  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  34.03 
 
 		 1005 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  43.6 
 
 		 475 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  33.28 
 
 		 977 aa  330  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1341 aa  322  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  31.71 
 
 		 1004 aa  273  2.9999999999999997e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  50.36 
 
 		 301 aa  272  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  30.85 
 
 		 921 aa  263  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1350  hypothetical protein  46.28 
 
 		 221 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.588656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1765  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1098 aa  159  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0310  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  22.33 
 
 		 1116 aa  153  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0066  hypothetical protein  48.75 
 
 		 165 aa  145  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  30.94 
 
 		 871 aa  141  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  22.55 
 
 		 1059 aa  125  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0925  adenine specific DNA methyltransferase  23.64 
 
 		 1049 aa  125  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00490448  normal  0.369503 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0499  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase, putative  21.97 
 
 		 1047 aa  114  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3195  adenine specific DNA methyltransferase  21.96 
 
 		 1125 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000607783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  21.19 
 
 		 1064 aa  99.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3803  helicase-like protein  21.99 
 
 		 1176 aa  87.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.230182  hitchhiker  0.00335378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1102  putative DNA methyltransferase  23.4 
 
 		 1100 aa  72.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.822518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2721  putative DNA methyltransferase  24.05 
 
 		 1121 aa  66.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  23.33 
 
 		 907 aa  63.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  21.62 
 
 		 1082 aa  63.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  22.71 
 
 		 469 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  24.25 
 
 		 813 aa  60.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0840  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  21.35 
 
 		 1068 aa  59.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  22.2 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0843  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  20.63 
 
 		 1068 aa  58.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.76009e-28 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  22.49 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  41.89 
 
 		 462 aa  58.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5510  putative DNA methyltransferase  19.93 
 
 		 555 aa  57  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113009  normal  0.19164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  23.37 
 
 		 492 aa  55.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  21.29 
 
 		 974 aa  55.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  19.7 
 
 		 707 aa  55.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  28.46 
 
 		 1113 aa  55.5  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  22.49 
 
 		 479 aa  55.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  26.67 
 
 		 811 aa  55.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  22.95 
 
 		 517 aa  54.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3537  type III restriction enzyme, res subunit  33.73 
 
 		 1130 aa  55.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0964  helicase domain-containing protein  34.12 
 
 		 84 aa  55.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.317266  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  24.17 
 
 		 1108 aa  55.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  22.68 
 
 		 493 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  22.47 
 
 		 706 aa  54.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  23.97 
 
 		 824 aa  54.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  20.04 
 
 		 815 aa  53.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  19.33 
 
 		 813 aa  54.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  32.91 
 
 		 469 aa  53.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2422  type III restriction enzyme, res subunit  30.06 
 
 		 1119 aa  52.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.567699  normal  0.274661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  26.95 
 
 		 776 aa  52.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  22.45 
 
 		 453 aa  52.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  29.18 
 
 		 821 aa  52.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  27.84 
 
 		 1137 aa  52  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  26.29 
 
 		 783 aa  52  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  25.25 
 
 		 827 aa  52  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  21.7 
 
 		 509 aa  52  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  32.95 
 
 		 629 aa  51.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  22.18 
 
 		 817 aa  52  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  26.07 
 
 		 815 aa  52  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  22.27 
 
 		 1133 aa  51.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 1233 aa  51.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  21.7 
 
 		 509 aa  51.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  24.81 
 
 		 761 aa  50.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  21.69 
 
 		 800 aa  51.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  22.77 
 
 		 499 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  32.73 
 
 		 1125 aa  51.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  22.11 
 
 		 787 aa  50.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  25.68 
 
 		 815 aa  49.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  20.66 
 
 		 698 aa  49.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  20.77 
 
 		 494 aa  49.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  30.86 
 
 		 1141 aa  49.3  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  27.62 
 
 		 1115 aa  48.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  26.17 
 
 		 825 aa  48.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  29.11 
 
 		 706 aa  48.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  22.9 
 
 		 459 aa  47.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  22.15 
 
 		 586 aa  47.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  24.49 
 
 		 946 aa  47.8  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  22.67 
 
 		 585 aa  47.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  28.24 
 
 		 848 aa  47.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  22.67 
 
 		 585 aa  47.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  26.22 
 
 		 824 aa  47.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  34.55 
 
 		 1287 aa  47.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  28.17 
 
 		 893 aa  46.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  21.67 
 
 		 696 aa  46.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.68 
 
 		 756 aa  46.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  35.19 
 
 		 1053 aa  46.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  37.5 
 
 		 928 aa  46.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  25.77 
 
 		 953 aa  46.2  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  25.77 
 
 		 953 aa  46.2  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  29.61 
 
 		 889 aa  45.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>