More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1103 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 756 aa  1506    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  45.87 
 
 		 769 aa  649    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  43.74 
 
 		 749 aa  622  1e-177  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  41.18 
 
 		 751 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  40.52 
 
 		 745 aa  560  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  42.5 
 
 		 750 aa  544  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  40.26 
 
 		 754 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  40.31 
 
 		 763 aa  525  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  39.61 
 
 		 749 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  39.25 
 
 		 751 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  39.65 
 
 		 749 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  38.05 
 
 		 776 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  37.09 
 
 		 808 aa  483  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  46.17 
 
 		 938 aa  473  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  40.76 
 
 		 820 aa  422  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  41.8 
 
 		 829 aa  420  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  40.82 
 
 		 836 aa  405  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  41.05 
 
 		 833 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  39.37 
 
 		 851 aa  400  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.92 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  33.27 
 
 		 971 aa  266  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  31.14 
 
 		 551 aa  246  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  31.71 
 
 		 1565 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  32.13 
 
 		 941 aa  228  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  31.94 
 
 		 1528 aa  226  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  35.78 
 
 		 233 aa  134  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  33.95 
 
 		 228 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  35.51 
 
 		 230 aa  119  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  37.67 
 
 		 212 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  34.15 
 
 		 217 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  36.84 
 
 		 212 aa  110  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  36.84 
 
 		 212 aa  109  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  34.74 
 
 		 234 aa  107  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  35.14 
 
 		 221 aa  105  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  36.28 
 
 		 212 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  36.28 
 
 		 212 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  31.65 
 
 		 246 aa  99.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  27.91 
 
 		 216 aa  95.5  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  30.6 
 
 		 211 aa  93.2  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  33.7 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  31.28 
 
 		 219 aa  82.8  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  27.84 
 
 		 214 aa  79  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  27.7 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08713  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  30.94 
 
 		 985 aa  77  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60166  predicted protein  24.93 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000965923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  27.42 
 
 		 215 aa  72.8  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  32.64 
 
 		 1051 aa  72.4  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0291  ERCC4  35.2 
 
 		 170 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  27.27 
 
 		 216 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  25.64 
 
 		 945 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  32.48 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  32.48 
 
 		 560 aa  68.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  32.48 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2653  type III restriction enzyme, res subunit  32.28 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42450  predicted protein  29.93 
 
 		 975 aa  64.7  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.488375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94867  predicted protein  34.88 
 
 		 575 aa  64.3  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0308188  normal  0.0300986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2576  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.96 
 
 		 422 aa  63.9  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  23.74 
 
 		 953 aa  63.9  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  33.33 
 
 		 1141 aa  63.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.82 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  30.61 
 
 		 1052 aa  62.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.94 
 
 		 762 aa  63.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.96 
 
 		 556 aa  62  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.78 
 
 		 981 aa  62  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.19 
 
 		 905 aa  60.8  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3711  putative ATP-dependent RNA helicase  35.09 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1775  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.7 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0367787 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01330  hypothetical protein  31.58 
 
 		 457 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01320  ATP-dependent RNA helicase, specific for 23S rRNA  31.58 
 
 		 457 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2300  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.58 
 
 		 457 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.21 
 
 		 514 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2282  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.58 
 
 		 457 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2005  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.09 
 
 		 589 aa  60.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1779  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.58 
 
 		 457 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1588  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.58 
 
 		 457 aa  60.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1557  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.58 
 
 		 457 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1992  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.58 
 
 		 457 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.639761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.64 
 
 		 538 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1460  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.58 
 
 		 457 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1680  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.82 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.240536  normal  0.0183656 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30908  excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4  37.66 
 
 		 975 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.09 
 
 		 846 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3579  DEAD/DEAH box helicase-like  31.82 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  25.25 
 
 		 949 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1498  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.82 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.798131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2474  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.6 
 
 		 544 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  26.74 
 
 		 946 aa  59.7  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  29.88 
 
 		 560 aa  60.1  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  32.28 
 
 		 560 aa  60.1  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1838  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.82 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.787138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.09 
 
 		 846 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1778  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.82 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  35.96 
 
 		 396 aa  60.1  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  31.65 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.4 
 
 		 812 aa  59.3  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.83 
 
 		 679 aa  59.3  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.63 
 
 		 950 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.79 
 
 		 682 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1733  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.46 
 
 		 712 aa  58.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>