More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2546 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  43.03 
 
 		 769 aa  662    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  64.22 
 
 		 851 aa  1053    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  69.07 
 
 		 820 aa  1143    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  100 
 
 		 836 aa  1679    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  66.15 
 
 		 833 aa  1067    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  68.44 
 
 		 829 aa  1135    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  45.53 
 
 		 749 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  40.76 
 
 		 938 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  33.13 
 
 		 749 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  43.79 
 
 		 745 aa  437  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  32.49 
 
 		 749 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  42.22 
 
 		 750 aa  423  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  43.43 
 
 		 751 aa  422  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  31.05 
 
 		 808 aa  412  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  40.54 
 
 		 763 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  40 
 
 		 754 aa  404  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.82 
 
 		 756 aa  405  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  35.45 
 
 		 751 aa  324  3e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  35.45 
 
 		 776 aa  323  7e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.89 
 
 		 502 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  33.79 
 
 		 1565 aa  241  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  29.82 
 
 		 551 aa  218  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  28.31 
 
 		 971 aa  215  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  31.5 
 
 		 1528 aa  212  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  28.68 
 
 		 941 aa  197  7e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  35.75 
 
 		 217 aa  120  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 212 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  30.95 
 
 		 212 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  32.86 
 
 		 212 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  32.86 
 
 		 212 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  31.9 
 
 		 212 aa  108  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  33.18 
 
 		 233 aa  102  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  30.09 
 
 		 216 aa  99.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  33.85 
 
 		 230 aa  96.7  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  32.09 
 
 		 234 aa  96.3  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  30.73 
 
 		 228 aa  90.5  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  31.48 
 
 		 246 aa  82.8  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  35 
 
 		 219 aa  75.9  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  32.86 
 
 		 215 aa  75.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  32.02 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  35.71 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  24.77 
 
 		 343 aa  69.7  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2576  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.61 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.69 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.57 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.57 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.39 
 
 		 591 aa  64.7  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.57 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.57 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  29.08 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01406  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  63.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94867  predicted protein  34.45 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0308188  normal  0.0300986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0819  DEAD/DEAH box helicase  30.54 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0359  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.17 
 
 		 453 aa  63.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.992502  normal  0.993295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2648  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.82 
 
 		 479 aa  63.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.59 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0501  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.77 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004056  ATP-dependent RNA helicase  32.54 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.668799  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0610  DEAD/DEAH box helicase-like  28.08 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.43 
 
 		 905 aa  61.6  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2166  excinuclease ABC subunit B  29.21 
 
 		 673 aa  61.6  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000274119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0791  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  27 
 
 		 624 aa  61.6  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000437602  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27821  predicted protein  38.53 
 
 		 822 aa  61.6  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.29 
 
 		 538 aa  61.2  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.43 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.1 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10380  Dicer-like protein 2 [Includes Endoribonuclease dcl2(EC 3.1.26.-);ATP-dependent helicase dcl2(EC 3.6.1.-)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C5H7]  31.94 
 
 		 1269 aa  61.2  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.917081  normal  0.453481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  27.09 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3057  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.84 
 
 		 577 aa  60.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.1 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.74 
 
 		 413 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0134965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  32.22 
 
 		 216 aa  60.8  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.1 
 
 		 433 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  27.92 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01266  Pre-mRNA-processing ATP-dependent RNA helicase prp5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDW4]  33.61 
 
 		 1173 aa  60.1  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505248  normal  0.0523257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  27.92 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.92 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2926  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.09 
 
 		 468 aa  60.1  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  30.36 
 
 		 946 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  27.92 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  27.92 
 
 		 455 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  30 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0709  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 422 aa  59.7  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0927  DEAD/DEAH box helicase-like  36.13 
 
 		 445 aa  59.7  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2752  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.73 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0362  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.98 
 
 		 562 aa  60.1  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0486542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.73 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2796  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.37 
 
 		 423 aa  60.1  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2988  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.1 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  27.92 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  27.92 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3682  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30 
 
 		 601 aa  59.7  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3027  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.78 
 
 		 414 aa  60.1  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.58 
 
 		 545 aa  60.1  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06640  Pre-mRNA splicing factor RNA helicase PRP28, putative  29.11 
 
 		 738 aa  59.3  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.847821  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.65 
 
 		 918 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2061  excinuclease ABC subunit B  28.71 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000836148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.65 
 
 		 918 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.65 
 
 		 918 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3701  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000590991  normal  0.0343831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>