175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0400 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  100 
 
 		 221 aa  448  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.14 
 
 		 756 aa  105  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  35.02 
 
 		 751 aa  91.3  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  31.67 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  29.28 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  30.67 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  31.65 
 
 		 938 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  31.36 
 
 		 745 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  31.22 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  28.57 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  34.83 
 
 		 750 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  32.13 
 
 		 808 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  32.72 
 
 		 749 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  32.26 
 
 		 749 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  31.39 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  31.39 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  32.64 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  31.8 
 
 		 751 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  27.48 
 
 		 769 aa  71.6  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  28.57 
 
 		 763 aa  71.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  30.9 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  29.74 
 
 		 851 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  28.83 
 
 		 749 aa  69.3  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  28.27 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  31.61 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  29.36 
 
 		 776 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  26.75 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  30.14 
 
 		 754 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  29.08 
 
 		 836 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  26.7 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  28.71 
 
 		 833 aa  62.4  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  25.13 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 631 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1728  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 688 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0415792 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  43.64 
 
 		 644 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  24.89 
 
 		 246 aa  52.8  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  44.23 
 
 		 635 aa  52.4  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 609 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 704 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 		 695 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3146  excinuclease ABC subunit C  43.4 
 
 		 690 aa  51.6  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.055346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  50.98 
 
 		 615 aa  51.6  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  52.08 
 
 		 607 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2526  excinuclease ABC subunit C  43.4 
 
 		 666 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 639 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 695 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 		 631 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  41.07 
 
 		 608 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  25.5 
 
 		 820 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 746 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  26.53 
 
 		 829 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  41.07 
 
 		 608 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  36.67 
 
 		 612 aa  49.7  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0901  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 699 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.686054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  46.94 
 
 		 663 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  44.64 
 
 		 607 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 		 623 aa  48.9  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  46.15 
 
 		 598 aa  48.5  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 		 623 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1363  excinuclease ABC subunit C  42.19 
 
 		 661 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.205269  normal  0.348926 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 641 aa  48.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  38.18 
 
 		 647 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0423  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.86 
 
 		 660 aa  47  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0154  excinuclease ABC subunit C  39.29 
 
 		 605 aa  47.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.168899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2488  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 716 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820608  normal  0.0424579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 		 656 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2652  excinuclease ABC, C subunit  40.38 
 
 		 668 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  44.23 
 
 		 636 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  42 
 
 		 681 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1232  excinuclease ABC subunit C  43.48 
 
 		 680 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101228 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  40.38 
 
 		 385 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  40.38 
 
 		 707 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  35.29 
 
 		 614 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1086  excinuclease ABC subunit C  40.38 
 
 		 680 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000501867 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  39.62 
 
 		 618 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  40.38 
 
 		 613 aa  45.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  45.65 
 
 		 690 aa  45.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  37.74 
 
 		 611 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3713  excinuclease ABC, C subunit  38.46 
 
 		 668 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0947  DNA ligase, NAD-dependent  40 
 
 		 675 aa  45.8  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 707 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  40.38 
 
 		 623 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  33.82 
 
 		 614 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  40.38 
 
 		 619 aa  45.4  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 		 613 aa  45.4  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  38.46 
 
 		 707 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  33.82 
 
 		 645 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  57.89 
 
 		 628 aa  45.1  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 		 622 aa  45.1  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1861  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 		 609 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  47.83 
 
 		 624 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 		 609 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 		 609 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  33.33 
 
 		 648 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 		 609 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  40.82 
 
 		 636 aa  44.3  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 		 646 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2344  excinuclease ABC, C subunit  35.85 
 
 		 779 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.77277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  24.37 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  40 
 
 		 647 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>