47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0083 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  100 
 
 		 230 aa  464  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  54.31 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  36.62 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.51 
 
 		 756 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  36.22 
 
 		 938 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  35.05 
 
 		 808 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  32.54 
 
 		 769 aa  105  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  35.05 
 
 		 749 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  32.16 
 
 		 763 aa  102  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  35.05 
 
 		 751 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  34.02 
 
 		 749 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  33.87 
 
 		 211 aa  98.2  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  34.04 
 
 		 851 aa  95.9  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  31.77 
 
 		 751 aa  96.3  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  34.1 
 
 		 836 aa  94.7  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  31.65 
 
 		 776 aa  94  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  32.27 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  29.58 
 
 		 749 aa  90.9  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  30.41 
 
 		 745 aa  89  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  29.33 
 
 		 750 aa  89  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  30.38 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  32.65 
 
 		 820 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  31.79 
 
 		 833 aa  87  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  29.19 
 
 		 217 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  29.68 
 
 		 754 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  31.25 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  29.41 
 
 		 829 aa  81.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  33.03 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  30.63 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  30.63 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  29.82 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  28.57 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  28.11 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  29.74 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  28.88 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  31.14 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  30.93 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  26.91 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08713  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  35.9 
 
 		 985 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0291  ERCC4  29.03 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42450  predicted protein  23.38 
 
 		 975 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.488375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60166  predicted protein  35.44 
 
 		 564 aa  56.2  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000965923 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  23.47 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30908  excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4  25 
 
 		 975 aa  52.4  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01820  conserved hypothetical protein  35.9 
 
 		 1099 aa  51.6  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  25.97 
 
 		 343 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  28.21 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>