35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60166 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_60166  predicted protein  100 
 
 		 564 aa  1165    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000965923 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08713  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  33.5 
 
 		 985 aa  319  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01820  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 		 1099 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42450  predicted protein  39.35 
 
 		 975 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.488375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30908  excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4  29.17 
 
 		 975 aa  219  8.999999999999998e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  41.98 
 
 		 228 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  26.98 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  26.97 
 
 		 769 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  44.58 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.34 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  40.96 
 
 		 938 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  39.53 
 
 		 829 aa  62  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  38.37 
 
 		 820 aa  60.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  21.79 
 
 		 216 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  28.11 
 
 		 749 aa  57  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  35.23 
 
 		 246 aa  56.6  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  35.44 
 
 		 230 aa  56.2  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  27.67 
 
 		 749 aa  57  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  35 
 
 		 851 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  23.53 
 
 		 776 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  28.64 
 
 		 749 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  26.21 
 
 		 751 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  34.52 
 
 		 833 aa  55.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  40 
 
 		 217 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  24.61 
 
 		 763 aa  52  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  27.16 
 
 		 234 aa  50.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  33.33 
 
 		 751 aa  50.4  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  24.73 
 
 		 750 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  23.27 
 
 		 212 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  35.44 
 
 		 214 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  36.71 
 
 		 219 aa  45.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  34.67 
 
 		 836 aa  45.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  31.65 
 
 		 215 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  23.11 
 
 		 808 aa  44.7  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  35.06 
 
 		 754 aa  44.3  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>