48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0877 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  37.09 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  37.67 
 
 		 219 aa  130  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  39.67 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  34.1 
 
 		 938 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  39.66 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  36.28 
 
 		 769 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  34.53 
 
 		 215 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  37.78 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  34.26 
 
 		 763 aa  104  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  33.33 
 
 		 749 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  32.72 
 
 		 751 aa  101  8e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.65 
 
 		 756 aa  99.8  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  32.88 
 
 		 745 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  31.31 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  35.16 
 
 		 754 aa  95.1  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  28.57 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  30 
 
 		 750 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  30.33 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  30.38 
 
 		 230 aa  87.8  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  31.05 
 
 		 749 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  33.65 
 
 		 217 aa  85.5  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  31.05 
 
 		 749 aa  85.5  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  28.84 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  28.84 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  30.14 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  29.49 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  30.14 
 
 		 751 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  27.88 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  30.41 
 
 		 833 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  31.34 
 
 		 820 aa  78.6  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  30.8 
 
 		 829 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  30.81 
 
 		 836 aa  77  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  30.59 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  29.3 
 
 		 776 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  28.17 
 
 		 808 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  28.9 
 
 		 851 aa  66.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0291  ERCC4  29.86 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  30.57 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30908  excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 4  25.21 
 
 		 975 aa  58.9  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60166  predicted protein  35.23 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000965923 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  24.89 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08713  single-stranded DNA endonuclease (Eurofung)  35.8 
 
 		 985 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42450  predicted protein  37.8 
 
 		 975 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.488375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  27.15 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01820  conserved hypothetical protein  36.71 
 
 		 1099 aa  49.7  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0086  hypothetical protein  34.26 
 
 		 177 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.176439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  32.46 
 
 		 158 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>