More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0813 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  61.09 
 
 		 754 aa  914    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  57.62 
 
 		 750 aa  872    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  52.76 
 
 		 763 aa  795    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  100 
 
 		 745 aa  1528    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  62.8 
 
 		 751 aa  966    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  44.66 
 
 		 769 aa  664    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  43.34 
 
 		 749 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  39.32 
 
 		 820 aa  560  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.52 
 
 		 756 aa  555  1e-156  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  35.91 
 
 		 749 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  35.73 
 
 		 751 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  35.95 
 
 		 749 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  45.4 
 
 		 829 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  48.14 
 
 		 938 aa  452  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  33.71 
 
 		 776 aa  439  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  43.79 
 
 		 836 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  42.8 
 
 		 851 aa  436  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  33.21 
 
 		 808 aa  409  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  42.91 
 
 		 833 aa  412  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.09 
 
 		 502 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  31.48 
 
 		 971 aa  239  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  33.65 
 
 		 551 aa  233  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  30.74 
 
 		 1565 aa  209  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  29.01 
 
 		 941 aa  192  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  34.65 
 
 		 1528 aa  125  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  32.41 
 
 		 233 aa  107  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  33.33 
 
 		 217 aa  107  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  32.68 
 
 		 212 aa  98.6  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  32.88 
 
 		 246 aa  97.4  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  29.17 
 
 		 216 aa  96.3  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  33.66 
 
 		 212 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  35.96 
 
 		 219 aa  95.9  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  32.85 
 
 		 212 aa  94  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  32.85 
 
 		 212 aa  94  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  33.65 
 
 		 234 aa  92.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  30.41 
 
 		 230 aa  89  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  32.95 
 
 		 211 aa  87.8  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  29 
 
 		 228 aa  87.8  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  31.34 
 
 		 212 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  31.36 
 
 		 221 aa  82.8  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  31.25 
 
 		 214 aa  82.4  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  29.74 
 
 		 215 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  26.86 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  25.67 
 
 		 215 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  28.41 
 
 		 216 aa  69.7  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03093  ATP-dependent RNA helicase SrmB  33.33 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3579  DEAD/DEAH box helicase-like  28.3 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0855  ATP-dependent RNA helicase DeaD  39.25 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.521199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0847  ATP-dependent RNA helicase DeaD  39.25 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.348098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0790  ATP-dependent RNA helicase SrmB  35.25 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3336  ATP-dependent RNA helicase SrmB  35.25 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  28.24 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3233  ATP-dependent RNA helicase SrmB  35.25 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3452  ATP-dependent RNA helicase SrmB  35.25 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3527  ATP-dependent RNA helicase SrmB  35.25 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0840  ATP-dependent RNA helicase SrmB  35.25 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0887  ATP-dependent RNA helicase SrmB  35.25 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0744  ATP-dependent RNA helicase SrmB  32.37 
 
 		 411 aa  67  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3646  ATP-dependent RNA helicase SrmB  35.25 
 
 		 419 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0947  ATP-dependent RNA helicase SrmB  34.53 
 
 		 420 aa  66.6  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94867  predicted protein  34.4 
 
 		 575 aa  65.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0308188  normal  0.0300986 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  36.3 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0802  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.65 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  31.34 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0890  ATP-dependent RNA helicase SrmB  33.09 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724766 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.21 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.395802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0892  ATP-dependent RNA helicase SrmB  32.37 
 
 		 408 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3036  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  31.65 
 
 		 453 aa  63.9  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0655  ATP-independent RNA helicase  35.85 
 
 		 446 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2742  ATP-dependent RNA helicase SrmB  32.37 
 
 		 613 aa  63.9  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1011  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.26 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0299  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.11 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.22 
 
 		 562 aa  63.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0362  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.56 
 
 		 562 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0486542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3284  ATP-dependent RNA helicase SrmB  31.08 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.62 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.536242  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1434  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.94 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1422  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  29.94 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.219008 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06640  Pre-mRNA splicing factor RNA helicase PRP28, putative  33.33 
 
 		 738 aa  62  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.847821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.22 
 
 		 579 aa  62  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119399  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.28 
 
 		 581 aa  62  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.26 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1190  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.2 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107478 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  26.14 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.11 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2643  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.58 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.15 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3598  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.11 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12760  ATP-dependent RNA helicase  30.67 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00382469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.26 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19290  putative ATP-dependent RNA helicase  35 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4097  ATP-dependent RNA helicase SrmB  32.86 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.872576  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4532  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.09 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.94 
 
 		 427 aa  60.1  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 440 aa  60.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2576  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.83 
 
 		 422 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27821  predicted protein  42.68 
 
 		 822 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>