More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0655 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0655  ATP-independent RNA helicase  100 
 
 		 446 aa  914    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0970  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.12 
 
 		 436 aa  498  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.08 
 
 		 453 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.102362  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1011  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.36 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3331  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.73 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10148  ATP-independent RNA helicase  47.13 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00683  ATP-dependent RNA helicase DbpA  35.41 
 
 		 459 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3498  ATP-dependent RNA helicase DbpA  36.36 
 
 		 469 aa  243  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0690  ATP-dependent RNA helicase DbpA  36.1 
 
 		 469 aa  243  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0948  ATP-dependent RNA helicase DbpA  35.45 
 
 		 468 aa  242  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0189  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.46 
 
 		 460 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0598  ATP-dependent RNA helicase DbpA  35.28 
 
 		 468 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.255467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0752  ATP-dependent RNA helicase DbpA  37.61 
 
 		 467 aa  239  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.748703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0588  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.4 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0855  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.69 
 
 		 478 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.521199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0847  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.69 
 
 		 478 aa  237  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.348098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3852  ATP-dependent RNA helicase DbpA  36.1 
 
 		 458 aa  236  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.02646 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0750  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.45 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2724  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.38 
 
 		 462 aa  233  6e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.566366  normal  0.0215691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0903  ATP-dependent RNA helicase DbpA  36.26 
 
 		 458 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3468  ATP-dependent RNA helicase DbpA  36.26 
 
 		 458 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0893  ATP-dependent RNA helicase DbpA  36.26 
 
 		 469 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0868  ATP-dependent RNA helicase DbpA  36.26 
 
 		 458 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3110  ATP-dependent RNA helicase DbpA  36.26 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3384  ATP-dependent RNA helicase DbpA  35.73 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1394  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.23 
 
 		 474 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0745  ATP-dependent RNA helicase DbpA  35.73 
 
 		 458 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3275  ATP-dependent RNA helicase DbpA  35.73 
 
 		 479 aa  230  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3216  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.68 
 
 		 467 aa  229  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0897  ATP-dependent RNA helicase DbpA  36.57 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2143  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.33 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.713683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2949  ATP-dependent RNA helicase DbpA  35.48 
 
 		 470 aa  227  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00762  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.38 
 
 		 459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3020  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.13 
 
 		 465 aa  226  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.93907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0141  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.26 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1129  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.44 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.965871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001711  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.61 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5001  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.18 
 
 		 461 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00394  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.07 
 
 		 458 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.793694  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2141  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.08 
 
 		 460 aa  223  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0253787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1557  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.5 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2027  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.56 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.49 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1838  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.02 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.787138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1588  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.88 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4825  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.74 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1779  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.5 
 
 		 457 aa  220  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4952  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.43 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1775  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.02 
 
 		 457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0367787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1680  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.02 
 
 		 457 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.240536  normal  0.0183656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01320  ATP-dependent RNA helicase, specific for 23S rRNA  32.27 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2300  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.27 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2282  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.27 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01330  hypothetical protein  32.27 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1460  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.27 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05950  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.56 
 
 		 458 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.214385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1498  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.79 
 
 		 457 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.798131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1778  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.79 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1992  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.27 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.639761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1847  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.18 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5284  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.77 
 
 		 467 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1428  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.13 
 
 		 490 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2804  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.91 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0473713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.49 
 
 		 481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.01 
 
 		 487 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0513  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.29 
 
 		 461 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227206  normal  0.370173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0558  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.88 
 
 		 458 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3577  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.13 
 
 		 473 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.93 
 
 		 590 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1629  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.67 
 
 		 458 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.606016  normal  0.220561 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0146  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.73 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2040  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.05 
 
 		 468 aa  212  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2042  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.05 
 
 		 468 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5370  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  30.34 
 
 		 481 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200249  hitchhiker  0.000118205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2843  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.98 
 
 		 460 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2350  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.58 
 
 		 460 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2446  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.58 
 
 		 460 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1633  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.58 
 
 		 460 aa  209  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4245  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.1 
 
 		 477 aa  209  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0647  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.63 
 
 		 464 aa  209  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.32 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.168569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.73 
 
 		 565 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.43 
 
 		 643 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0650  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.73 
 
 		 468 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5592  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.91 
 
 		 481 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.99386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0479  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.21 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5307  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.7 
 
 		 481 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5135  ATP-dependent RNA helicase  29.7 
 
 		 481 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.557571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5149  ATP-dependent RNA helicase  29.7 
 
 		 481 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5703  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.7 
 
 		 481 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5577  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  30.13 
 
 		 481 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.652435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5548  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  29.7 
 
 		 481 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5639  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  29.91 
 
 		 481 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0860387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5247  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.34 
 
 		 481 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3184  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.19 
 
 		 465 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0039  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.15 
 
 		 474 aa  206  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0622  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.11 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5240  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.56 
 
 		 464 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1944  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.98 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.423586  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0202  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.83 
 
 		 465 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.718182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>