More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1011 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1011  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 435 aa  887    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0655  ATP-independent RNA helicase  54.36 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0970  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.65 
 
 		 436 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.78 
 
 		 453 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.102362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3331  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.35 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10148  ATP-independent RNA helicase  47.92 
 
 		 437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0588  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.24 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2040  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.61 
 
 		 468 aa  237  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2143  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.44 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.713683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2042  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.38 
 
 		 468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.18 
 
 		 487 aa  232  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554014  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1680  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.41 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.240536  normal  0.0183656 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0948  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.16 
 
 		 468 aa  230  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00683  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.67 
 
 		 459 aa  230  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1775  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.41 
 
 		 457 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0367787 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1838  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.41 
 
 		 457 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.787138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1498  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.41 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.798131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1778  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.18 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0750  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.84 
 
 		 463 aa  226  8e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1394  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.79 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2027  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.26 
 
 		 457 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2141  ATP-dependent RNA helicase DbpA  35.57 
 
 		 460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0253787  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3020  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.56 
 
 		 465 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.93907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0598  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.18 
 
 		 468 aa  223  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.255467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1129  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.96 
 
 		 466 aa  223  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.965871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1588  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.26 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.48 
 
 		 438 aa  223  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01320  ATP-dependent RNA helicase, specific for 23S rRNA  32.03 
 
 		 457 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1460  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.03 
 
 		 457 aa  222  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2300  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.03 
 
 		 457 aa  222  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2282  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.03 
 
 		 457 aa  222  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01330  hypothetical protein  32.03 
 
 		 457 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1557  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.03 
 
 		 457 aa  222  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1992  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.03 
 
 		 457 aa  222  9e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.639761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3498  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.03 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00394  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.41 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.793694  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1779  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.03 
 
 		 457 aa  221  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3852  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.8 
 
 		 458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.02646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3184  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.78 
 
 		 465 aa  219  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3216  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.64 
 
 		 467 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2949  ATP-dependent RNA helicase DbpA  34.52 
 
 		 470 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05950  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.41 
 
 		 458 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.214385 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00762  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.71 
 
 		 459 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0189  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.63 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0647  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.41 
 
 		 464 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5284  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.47 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1847  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.1 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0745  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.41 
 
 		 458 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3384  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.41 
 
 		 479 aa  217  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3577  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.43 
 
 		 473 aa  216  9e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3275  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.18 
 
 		 479 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0690  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.57 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0752  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.26 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.748703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3110  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.51 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5248  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.79 
 
 		 478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001711  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.41 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177181  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0558  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.26 
 
 		 458 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0903  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.29 
 
 		 458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0868  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.29 
 
 		 458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4245  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.92 
 
 		 477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3468  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.29 
 
 		 458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0141  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.5 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0893  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.29 
 
 		 469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0146  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.52 
 
 		 462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5240  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.44 
 
 		 464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2724  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.13 
 
 		 462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.566366  normal  0.0215691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0622  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.43 
 
 		 465 aa  213  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0479  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.81 
 
 		 458 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1629  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.37 
 
 		 458 aa  212  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.606016  normal  0.220561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5212  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.7 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1944  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.2 
 
 		 465 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.423586  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2804  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.82 
 
 		 460 aa  210  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0473713 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0489  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.02 
 
 		 469 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0039  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.55 
 
 		 474 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2223  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.97 
 
 		 463 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1248  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.97 
 
 		 463 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0961  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.97 
 
 		 465 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1659  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.97 
 
 		 465 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0202  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.97 
 
 		 465 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.718182  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0291  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.75 
 
 		 465 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0516  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.24 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0214  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.43 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5007  ATP-independent RNA helicase DbpA  31.8 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4313  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.96 
 
 		 465 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  hitchhiker  0.00000166759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4825  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.77 
 
 		 494 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5098  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.64 
 
 		 465 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3249  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.64 
 
 		 465 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3705  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.58 
 
 		 469 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0825839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0650  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.75 
 
 		 468 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4952  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.92 
 
 		 461 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2843  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.75 
 
 		 460 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0513  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.86 
 
 		 461 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227206  normal  0.370173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0897  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.03 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4994  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.96 
 
 		 465 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.317597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1428  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.14 
 
 		 490 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.59 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2952  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.75 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5001  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.7 
 
 		 461 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.19 
 
 		 527 aa  203  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3711  putative ATP-dependent RNA helicase  34.85 
 
 		 436 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>