More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0970 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0970  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 436 aa  894    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0655  ATP-independent RNA helicase  55.12 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3331  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.44 
 
 		 441 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1011  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.65 
 
 		 435 aa  467  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.46 
 
 		 453 aa  455  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.102362  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10148  ATP-independent RNA helicase  46.39 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1847  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.33 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1838  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.3 
 
 		 457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.787138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1680  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.08 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.240536  normal  0.0183656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1498  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.3 
 
 		 457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.798131  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1778  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.3 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0189  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.16 
 
 		 460 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1775  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.08 
 
 		 457 aa  233  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0367787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2027  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.33 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0948  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.48 
 
 		 468 aa  228  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2143  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.19 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.713683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1394  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.86 
 
 		 474 aa  226  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5248  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.59 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0750  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.49 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1557  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.36 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1588  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.36 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0588  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.22 
 
 		 459 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2843  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.86 
 
 		 460 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1992  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.77 
 
 		 457 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.639761 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01320  ATP-dependent RNA helicase, specific for 23S rRNA  30.77 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2300  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.77 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2282  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.77 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1460  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.77 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01330  hypothetical protein  30.77 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1779  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.36 
 
 		 457 aa  222  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.184016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3020  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.34 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.93907  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2446  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.19 
 
 		 460 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2350  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.19 
 
 		 460 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2949  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.87 
 
 		 470 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1633  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.19 
 
 		 460 aa  220  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0745  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.26 
 
 		 458 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0690  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.87 
 
 		 469 aa  219  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3384  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.26 
 
 		 479 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4952  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.68 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4825  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.68 
 
 		 494 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0463433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5001  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.68 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3852  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.18 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.02646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3275  ATP-dependent RNA helicase DbpA  33.26 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.37 
 
 		 487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554014  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1428  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.49 
 
 		 490 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1129  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.02 
 
 		 466 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.965871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0141  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.34 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2804  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.31 
 
 		 460 aa  216  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0473713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3498  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.95 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0516  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.25 
 
 		 473 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0513  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.23 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227206  normal  0.370173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00394  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.13 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.793694  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5007  ATP-independent RNA helicase DbpA  31.25 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.41 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0847  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.26 
 
 		 478 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.348098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0752  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.72 
 
 		 467 aa  213  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.748703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0855  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.26 
 
 		 478 aa  212  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.521199  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00762  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.43 
 
 		 459 aa  212  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4245  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.29 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00683  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.21 
 
 		 459 aa  212  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0647  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.82 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001711  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.11 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0479  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.59 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.168569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0650  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.59 
 
 		 468 aa  211  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05950  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.14 
 
 		 458 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.214385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2724  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.79 
 
 		 462 aa  210  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.566366  normal  0.0215691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0598  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.26 
 
 		 468 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.255467 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3577  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.3 
 
 		 473 aa  210  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0897  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.76 
 
 		 458 aa  209  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2042  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.86 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2040  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.63 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5284  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.4 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3216  ATP-dependent RNA helicase DbpA  32.65 
 
 		 467 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3468  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.26 
 
 		 458 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0903  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.26 
 
 		 458 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0893  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.26 
 
 		 469 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0868  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.26 
 
 		 458 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3110  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.03 
 
 		 458 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0558  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.31 
 
 		 458 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0489  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.84 
 
 		 469 aa  206  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0622  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.7 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3705  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.23 
 
 		 469 aa  205  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0825839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1248  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.39 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1659  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.39 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0202  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.39 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.718182  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2223  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.39 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0961  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.39 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0146  ATP-dependent RNA helicase DbpA  31.9 
 
 		 462 aa  203  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0291  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.16 
 
 		 465 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.09 
 
 		 481 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516216  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1944  ATP-dependent RNA helicase DbpA  30.16 
 
 		 465 aa  202  9e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.423586  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4313  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.56 
 
 		 465 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  hitchhiker  0.00000166759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0039  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.52 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.53 
 
 		 605 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.3 
 
 		 545 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3753  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.02 
 
 		 908 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237591  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.53 
 
 		 634 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.3 
 
 		 467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5240  ATP-dependent RNA helicase DbpA  29.7 
 
 		 464 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>