More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53391 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  100 
 
 		 941 aa  1941    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  39.18 
 
 		 971 aa  466  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  34.92 
 
 		 1528 aa  375  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  34.81 
 
 		 551 aa  318  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  32.78 
 
 		 1565 aa  313  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  28.01 
 
 		 749 aa  240  8e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.94 
 
 		 756 aa  228  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  28.4 
 
 		 769 aa  218  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  28.43 
 
 		 749 aa  209  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  28.24 
 
 		 751 aa  205  4e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  28.22 
 
 		 829 aa  204  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  28.68 
 
 		 836 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  27.85 
 
 		 749 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  29.09 
 
 		 745 aa  201  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  29.45 
 
 		 750 aa  200  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  28.1 
 
 		 938 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  27.93 
 
 		 776 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  27.55 
 
 		 820 aa  196  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  27.16 
 
 		 851 aa  196  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  26.88 
 
 		 833 aa  188  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  27.88 
 
 		 754 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  27.71 
 
 		 808 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  28.06 
 
 		 751 aa  184  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.43 
 
 		 502 aa  179  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  35.27 
 
 		 763 aa  127  9e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 625 aa  63.9  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 621 aa  63.9  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 655 aa  63.9  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 653 aa  63.9  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 632 aa  63.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 629 aa  63.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 629 aa  63.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 629 aa  63.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 629 aa  63.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 664 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 664 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 624 aa  63.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 664 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  37.78 
 
 		 581 aa  62.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.44 
 
 		 629 aa  62.4  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  33.93 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  33.93 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.33 
 
 		 651 aa  62  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.33 
 
 		 651 aa  62  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.33 
 
 		 651 aa  62  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  33.33 
 
 		 629 aa  62  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 629 aa  62  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.33 
 
 		 629 aa  62  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.33 
 
 		 629 aa  62  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 629 aa  62  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.33 
 
 		 629 aa  62  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.78 
 
 		 550 aa  62  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01970  pre-mRNA splicing factor, putative  36.9 
 
 		 1072 aa  61.6  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.37 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 		 439 aa  60.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.05 
 
 		 538 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3342  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.12 
 
 		 607 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000502308  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2480  DEAD/DEAH box helicase-like  32.97 
 
 		 530 aa  60.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.045241  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0626  inducible ATP-independent RNA helicase  31.91 
 
 		 591 aa  60.1  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0914  ATP-dependent RNA helicase RhlE  32.69 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2573  ATP-dependent RNA helicase RhlE  29.92 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0628194  normal  0.940569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.94 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  31.22 
 
 		 1051 aa  59.7  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2926  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.96 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1680  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.52 
 
 		 677 aa  58.5  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2438  DEAD/DEAH box helicase-like  28.83 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.19 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3057  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.82 
 
 		 577 aa  58.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.54 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1190  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.91 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107478 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0169  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.23 
 
 		 561 aa  57  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000471101  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.71 
 
 		 591 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27821  predicted protein  36.05 
 
 		 822 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.77 
 
 		 590 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.81 
 
 		 447 aa  57.4  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000930018  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 		 564 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.83 
 
 		 528 aa  57.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.989648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  28.24 
 
 		 527 aa  57.4  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.91 
 
 		 481 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10851  putative ATP-dependent RNA helicase  38.55 
 
 		 604 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.638116  normal  0.290308 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0647  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.14 
 
 		 589 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.176165  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  30.92 
 
 		 1767 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2487  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.93 
 
 		 446 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.65 
 
 		 453 aa  56.6  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.756474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2715  putative ATP-dependent RNA helicase  37.08 
 
 		 434 aa  56.6  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2535  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.57 
 
 		 436 aa  56.6  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1257  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.52 
 
 		 460 aa  56.6  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.63 
 
 		 557 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 438 aa  57  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2952  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.68 
 
 		 419 aa  56.6  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.63 
 
 		 557 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  27.13 
 
 		 770 aa  56.6  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  33.01 
 
 		 493 aa  56.6  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.63 
 
 		 557 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0542  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.11 
 
 		 411 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.337517  normal  0.833057 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  34.57 
 
 		 601 aa  56.6  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14791  putative ATP-dependent RNA helicase  36.14 
 
 		 589 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459404  normal  0.230286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4532  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.54 
 
 		 440 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.58 
 
 		 504 aa  56.2  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.44 
 
 		 439 aa  56.2  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0826184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>