More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0640 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  100 
 
 		 749 aa  1521    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  95.34 
 
 		 751 aa  1443    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  57.8 
 
 		 808 aa  905    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  94.79 
 
 		 749 aa  1457    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0706  Hef nuclease  77.02 
 
 		 776 aa  1186    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.619505  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  41.57 
 
 		 769 aa  568  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0228  Hef nuclease  39.1 
 
 		 749 aa  543  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1103  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.48 
 
 		 756 aa  513  1e-144  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000146119  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3723  ERCC4 domain protein  34.07 
 
 		 820 aa  488  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1486  Hef nuclease  35.24 
 
 		 833 aa  474  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1980  helicase domain protein  33.17 
 
 		 829 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  35.91 
 
 		 745 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0800  Hef nuclease  33.49 
 
 		 851 aa  462  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.48491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1708  Hef nuclease  38.24 
 
 		 750 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1060  Hef nuclease  35.83 
 
 		 754 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1418  Hef nuclease  35.77 
 
 		 751 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1157  Hef nuclease  35.49 
 
 		 763 aa  442  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.931783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1208  Hef nuclease  39.84 
 
 		 938 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.599416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2546  Hef nuclease  35.25 
 
 		 836 aa  327  7e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.647176 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.19 
 
 		 502 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47619  predicted protein  30.74 
 
 		 1565 aa  211  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  29.37 
 
 		 971 aa  206  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53391  predicted protein  28.43 
 
 		 941 aa  205  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564935 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01670  conserved hypothetical protein  29.4 
 
 		 1528 aa  194  6e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35638  predicted protein  27.84 
 
 		 551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5061  ERCC4  38.21 
 
 		 217 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0296  helicase-associated endonuclease for fork-structured DNA  38.65 
 
 		 216 aa  122  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942206 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1786  ERCC4 domain protein  37.63 
 
 		 233 aa  117  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0169345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0365  ERCC4 domain-containing protein  39.56 
 
 		 212 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0437  ERCC4 domain-containing protein  35.24 
 
 		 228 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000467796 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0376  ERCC4 domain-containing protein  39.01 
 
 		 212 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0363  ERCC4 domain-containing protein  39.01 
 
 		 212 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  37.57 
 
 		 212 aa  104  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  38.12 
 
 		 212 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0083  ERCC4 domain-containing protein  35.05 
 
 		 230 aa  103  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.131653  hitchhiker  0.0000430873 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2438  ERCC4 domain-containing protein  34.07 
 
 		 234 aa  100  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.41003  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0877  ERCC4 domain-containing protein  31.05 
 
 		 246 aa  86.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  24.6 
 
 		 555 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1024  ERCC4 domain protein  31.63 
 
 		 215 aa  82  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2758  ERCC4 domain protein  27.64 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.863848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1706  ERCC4 domain-containing protein  36.54 
 
 		 211 aa  79.7  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0629  ERCC4 domain-containing protein  35.56 
 
 		 214 aa  78.6  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0400  ERCC4 domain protein  32.72 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  24.76 
 
 		 572 aa  76.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  24.95 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0726  ERCC4 domain-containing protein  32.2 
 
 		 219 aa  73.9  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1707  ERCC4 domain-containing protein  35.59 
 
 		 215 aa  73.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0341786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  22.65 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  23.15 
 
 		 560 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  23.15 
 
 		 560 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  23.15 
 
 		 560 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  23.15 
 
 		 560 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  23.15 
 
 		 560 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  23.79 
 
 		 560 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  23.15 
 
 		 560 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  23.73 
 
 		 560 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  23.81 
 
 		 560 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  31.25 
 
 		 905 aa  62  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1011  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.89 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2814  ERCC4 domain protein  25.71 
 
 		 220 aa  62  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  30.56 
 
 		 1046 aa  61.6  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1923  hypothetical protein  31.45 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00139334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0290  nuclease  57.14 
 
 		 51 aa  61.2  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.179128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3788  ERCC4 domain-containing protein  31.45 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.98 
 
 		 559 aa  60.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0905  hypothetical protein  32.77 
 
 		 158 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0333285  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001255  ATP-dependent RNA helicase  30 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.66 
 
 		 538 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2613  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 453 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.102362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1312  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  26.88 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0772  ERCC4 domain-containing protein  30.11 
 
 		 216 aa  59.7  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0649  superfamily II DNA and RNA helicase  26.09 
 
 		 728 aa  58.9  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0655  ATP-independent RNA helicase  30.47 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  32.17 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0790  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.6 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3233  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.6 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  31.93 
 
 		 1013 aa  58.5  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0947  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.08 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05125  ATP-dependent RNA helicase  30.39 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28472  ATP-dependent RNA helicase  22.38 
 
 		 836 aa  58.2  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3336  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.08 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60166  predicted protein  27.67 
 
 		 564 aa  57  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000965923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2952  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.63 
 
 		 419 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  29.72 
 
 		 998 aa  57  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10148  ATP-independent RNA helicase  27.56 
 
 		 437 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03359  ATP-dependent RNA helicase  30.08 
 
 		 405 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191775  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001506  ATP-dependent RNA helicase  26.77 
 
 		 430 aa  57  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000291883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2742  ATP-dependent RNA helicase SrmB  26.34 
 
 		 613 aa  57.4  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4097  ATP-dependent RNA helicase SrmB  29.19 
 
 		 417 aa  56.6  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.872576  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3646  ATP-dependent RNA helicase SrmB  25.77 
 
 		 419 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3527  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.08 
 
 		 419 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3115  inducible ATP-independent RNA helicase  32.21 
 
 		 457 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0660  ATP-dependent RNA helicase SrmB  25.91 
 
 		 406 aa  56.2  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3452  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.08 
 
 		 419 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0840  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.08 
 
 		 419 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0896  type III restriction enzyme, res subunit  29.27 
 
 		 845 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0970  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.23 
 
 		 436 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  33.59 
 
 		 801 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1474  DEAD/DEAH box helicase-like  29.22 
 
 		 384 aa  55.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.738757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  31.67 
 
 		 1065 aa  55.1  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>